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GraphPad菜鸟教程:手把手带大家做个column图

我虽然也只会用几个简单的功能(数了数大概也就四五个工具按钮而已),然而这基本就已经足够应付论文了(等我发了paper就能加一句应付杂志了)。如果你只会用Excel做统计图,强烈推荐学习一下GraphPad,用的溜绝对秒杀Excel(装逼能力专业水准一下子就蹭蹭蹭上去了)。所以大神们看到这儿就可以不用看下去了。小白们,让我这个高级菜鸟将毕生所学手把手传授给你们吧。


由于内容太长,这期首先讲一讲最简单的column做图。为什么说最简单呢?因为它只有单个坐标轴,不牵涉到分组。也就是说,比较适合用来处理大量样本的单次实验结果。


我用的是GraphPadPrism 6,其他版本大同小异。


(一)新建表格,输入数据


打开软件会出现选择界面,选择column,这里会出现几个选项,对菜鸟来说只要选择第一个就可以了(如图)。



新建表格的最上一行是名称,下面竖着输入(复制粘贴)相应数据。我这里统计了一下万事屋三月份的帖子阅读量,并将内容分为硬货、灌水、广告、搞笑四类(如下图所示),所以你们也可以看到GraphPad有一个致命弱点,就是不能显示中文(原谅我用拼音代替)。



第二列有一个高出天际的数值,这时候你可以点击下图说明框上面那个123舍弃按钮,数字变成斜杠加*后统计结果和统计图会自动更改。用这个按钮的好处是你依旧可以看到原始数据,将来想添加回来只需要再按一次那个按钮就行。


(二)统计学计算


GraphPad可以自动生成很多数据,除了传统的mean和SD,还有大家最爱的T-test和显著性P值。点击工具栏Analysis里的Analyze按钮,会出现如下选择框:



如果选择T-test,注意每次只能两两比较,选择两个比较的栏目后会出现下一个选择框,不用管什么都别改直接OK就行了。出来的结果如下图。



如果觉得两两比较太麻烦,可以选择之前对话框里t-test下面那个One-way ANOVA,出现的对话框第一选卡不用改,第二个选卡Multiple Comparisons点击第二个选项compare the mean of each column with the mean of every other column,然后OK。你会得到包含了所有列之间两两比较的结果,如下图。大家注意一下,左侧的工具栏里one-way下面有两个子文件,第一个对应选卡一,第二个对应选卡二(也就是说如果选卡二不选择就只会出现第一个子文件)。另外,同一份数据可以选择几个统计方式,只要不停的按Analyze,所以你可以同时看到t-test和one-way的结果(可能某个方法能做出更好的显著性,你懂得~~~)。



(三)做图及美化


点击左侧工具栏里的graphs目录下的子文件,会跳出选择图表类型的选框(见下图)。Column的特色是可以做散点图(选项的最后一个),相比柱状图不仅能看到平均值的差别还能直观看到样本的聚集位置和离散程度,所以我以散点图为例继续往下。(柱状图差不多可自行摸索,或关注后续教程)



点击OK生成统计图后双击每个柱子(散点那一条),会出现修改框(如下图),用以修改颜色、粗细等样式。推荐大家不要选择可爱粉冰魄蓝等奇怪的颜色,就用最鲜艳的红绿蓝紫,因为这些颜色最贴近显示器的RGB呈色,你在全世界任何国家任何一台电脑和彩色打印机上出的效果都有保障。添加显著性的线条在上方工具栏的Draw里,添加*就是旁边T那个选项手打几个*。做到这儿,差不多能得到这样一张图:(请无视线条没对齐的问题)



如果你觉得errorbar太大有点丑,还有一个补救方法,点击上方Change工具的第一个图标,会出现之前那个选择统计图类型的选项(如果你突然想换一个样式也是按这个),之后选择如下图鼠标位置,mean with SEM,这时你会看到下面的预览图发生了改变。当当当当!是不是瞬间就觉得bar小多了!不过也别太高兴,这样并不改变统计结果,你的*并不会因此变多,而且备注统计方法的时候专业人士一看就秒懂了。



(四)导出及后期处理


做完这些后,在统计图页面选择最上方的file,export,导出成TIF格式。拿到的图片已经可以用了。如果有更高级的需要,比如想要中文字,那就需要去photoshop进行进一步加工。具体的就不多说了,直接上结果。



扒完万事屋的老底后,我深深的觉得为大家写点干货还是很重要的啊!今天就策到这里吧。


...华丽丽的分割线...


李莫愁博士:非常感谢正文小马达的投稿,揭完我们的老底之后,我们深深地感觉到,再也接不到广告了。其次我们也感觉到了前所未有的压力,生产硬菜的压力,我们只有加倍努力了。




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