阴阳两仪乃太极原理中最重要的部分，也是中医学的重要理论基础，几千年来，它一直影响着中华民族的生活观与健康观。老子《道德经》三十五章说：“万物负阴而抱阳，冲气以为和。”人为万物之灵，中国传统医学认为，人体各部即有阴阳之分，健康运动养生自要遵循阴阳活动规律，调和阴阳，使人体小宇宙保持和谐的状态，终将与大宇宙相合达到天人合一。下面简述中医对人体阴阳的理解：
1.命门
又称为天根，位于人身正当中，前对脐，后对肾。清乾隆时期（1736-1795）武术家苌乃周认为：命门是人体的太极——阴阳的根源。
健身养体修炼的原则在于透过动作姿势使阴阳两气交结，从而达到促进健康、延缓衰老之目的。
2.奇经八脉
“奇经”是指体内有八条经脉的循行分布是“别道奇行”的正经，故又称“奇行之正经”，这是经络系统的重要组成部分，包括督脉、任脉、冲脉、带脉、阴维脉、阳维脉、阴跷脉、阳跷脉八条经脉。
其中督脉，行于背之当中，统领诸阳经；任脉行于腹之当中，统领诸阴经。所以人体背为阳，腹为阴。二经下交于会阴，上会于断交。
运动时，俯势为阴势，却是入阳气，益督脉，领诸阳经之气，尽归于上之前也。仰势为阳势，却是入阴气，益任脉，领诸阴经之气，尽归于上之后也。
（苌乃周 ，《苌氏武技书》（台北：逸文出版有限公司，1996），页1-3 。）
3.十二经脉
又名十二正经，是经络系统的主体。它们分别隶属于十二脏腑，各经用其所属脏腑的名称，结合循行于手足、内外、前中后的不同部位，并依据阴阳学说，给予不同的名称。十二经脉包括：手三阳，手三阴，足三阳，足三阴（手太阴肺经、手厥阴心包经、手少阴心经、手阳明大肠经、手少阳三焦经、手太阳小肠经、足太阴脾经、足厥阴肝经、足少阴肾经、足阳明胃经、足少阳胆经、足太阳膀胱经）。
韩衍金等通过对杨式太极拳搂膝拗步动作肌肉运动与经络关联的研究结论：结论：(1)左侧搂膝动作主要与手三阳经相联系,右臂屈肘外旋及推掌动作与手三阴、手三阳经相联系。(2)左脚上步成左弓步动作与足三阳经相关联,右腿单脚支撑与蹬伸动作与足太阴脾经及足阳明胃经、足太阳膀胱经相关联。
太极拳的每招每式都遵循着阴阳命理之道，因此，对人体的能量系统——经络具有理气疏导的作用，以促进血脉的周身畅通，保障身体各器官系统的能量供给及功能的健康运转，实为健康生存提供了符合自然之道的养生技法。
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