1、忽略卡方检验的应用条件
【原文1】佝偻病组与对照组的 VDR基因型分布频率见表1。
表1. 两组VDR基因型分布频率
(《中华儿科杂志》2005年发表)
【分析1】R×C资料χ2检验要求理论频数(注意不是实际频数)不宜太小,即有1/5以上格子的理论频数小于5,或有1个格子的理论频数小于1。如果遇到上述情况,有四种处理方法:
① 增大样本量;② 采用Fisher确切概率法;③ 将理论频数太小的行或列与性质相近的邻行或邻列合并;④ 删去理论频数太小的格子所对应的的行或列。
在该例中,有2个格子的理论值小于5,因此采用Fisher确切概率法,计算得到χ2=0.269,P=0.943,差异无统计学意义,不能认为两组的VDR基因型分布有差异。
【原文2】经查体甲状腺、心、肺、肝、脾阳性体征发生率,两组差异无显著性(P>0.05),见表2。
表2. 医用X线组与对照组阳性体征比较
(《预防医学文献信息》1997年发表)
【分析2】四格表χ2检验的应用条件为:
① 若n≥40且T>5时,用四格表χ2检验;② 若n≥40且1≤T≤5时,用校正四格表χ2检验;③ 若n<40或T<1时,用Fisher确切概率法。其中n为样本量,T为每个格子的理论频数(注意不是实际频数)。
在该例中,根据上述应用条件,甲状腺肿大、肺部异常、脾肿大三项应该采用Fisher 确切概率法,计算得三项均P>0.999,心脏异常、肝肿大两项应该采用校正四格表χ2检验,计算得两项χ2<0.001,P>0.999。
(SPSS操作及结果解读的更详细内容,请查看:独立样本四格表的卡方检验; 多个独立样本列联表的卡方检验)
2、不能正确运用卡方检验分析有序资料
【原文1】从表3看,治疗组总有效率高于对照组,差异有统计学意义(χ2=3.906,P<0.05)。
表3. 治疗组与对照组疗效比较 (例(%))
(《针灸临床杂志》2010年发表)
【分析1】该研究实际上是将表3中的治愈、显效、有效三列数据合并为“有效”一列,然后与“无效”构成四格表的形式进行了四格表的χ2检验,读取了pearson卡方值,此时方法应用的本身并无错误,但是合并之后忽略了疗效的“等级”信息,相当于把信息粗化了。
该资料为单向有序资料,可以选择χ2检验的方法进行分析,但应读取linear-by-linear association的结果,即linear-by-linear association统计量为6.182,P<0.001,认为治疗组和对照组的疗效总体分布不同。
【原文2】
表4. 不同年龄组超重与肥胖的分布情况
(《湘南学院学报》2004年发表)
【分析2】对于双向有序且属性不同的资料(以表4为例):
① 若研究目的是了解不同年龄组的BMI分布情况,可使用χ2检验,读取linear-by-linear association的结果;
② 若研究目的是了解年龄与BMI之间的相关关系,使用等级相关分析;
③ 若研究目的是想了解是否随着年龄的增长,BMI呈上升趋势,则可以采用χ2检验中ordinal中的gamma方法。
本研究是想了解年龄与BMI之间的关系,故应该采用等级相关分析,原文使用χ2检验方法是不对的。Spearman秩相关分析结果为:相关系数0.293,P<0.001,总体相关系数具有统计学意义。
(详细介绍请查看:碰见有序分类资料,怎么办?)
3、误用一般卡方检验分析配对资料
【原文】用念珠菌显色培养基和沙保培养基,对3种念珠菌同时平行接种进行生长试验比较。结果经χ2检验,沙保培养基对白色念珠菌和热带念珠菌差异有显著意义P<0.01和P<0.05,而克柔念珠菌对这两种培养基差异无显著意义P>0.5,结果见表5。
表5. 两种培养基对126株念珠菌在48h生长情况(株)比较
(《中华医学检验杂志》1999年发表)
【分析】该研究为配对设计,应该采用配对四格表的χ2检验。因为独立样本四格表资料,研究对象是随机分配的,不同组的数据相互独立;而配对四格表资料中,研究对象事先以某种方式配对,然后再根据不同组进行统计,结果不是相互独立的。
配对四格表χ2检验的应用条件为:① 若b+c≥40,应用配对四格表χ2检验计算公式;② 若b+c<40,需作连续性校正。
根据上述应用条件重新计算,得到三组χ2值和P值分别为χ21=21.43,P1<0.01;χ22=10.32,P2<0.01;χ23=5.33,P3<0.05;三组差异均有统计学意义。此外该研究还存在明显的错误,即原文描述与表格中的数据并不相符。
(SPSS操作及结果解读的更详细内容,请查看:一致性检验和配对卡方检验)
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