治病必求于本，这个本就是病因。如果病因不明，治疗就迷失了方向，不知该如何治？可疾病的真正原因是什么呢？在这一点上，中医和西医有着本质的不同。
西医靠精密仪器来认识人体，它发现了疾病往往和局部细胞病变有一定的对应关系，于是就假定了局部细胞病变为病，发现了细胞病变那就是有病，没有发现细胞病变那就是没病。
中医靠哲学的思辨来认识人体，通过人体系统与地球系统的类比，先人不仅发现了人与自然的关系，得出了疾病的外因是人与自然的矛盾激化，而且发现了整体与局部的关系，得出了疾病的内因是不平衡引起的整体管理失控。
显然，哲学的思辨就是不一般，它有内因和外因之分，内因是疾病产生的根本，外因是疾病产生的条件。而西医则完全抛弃了哲学，没有什么内因和外因，它把人当成是死的机器，零件坏了，那就是病了，零件看起来是好的，那就是没病。
现在的问题来了，人与自然真的没有关系呢？或者说疾病和自然没有关系吗？在中医学中，人是地球的一个缩影，水在地球表面占70%，在人体也占70%，而且其中的化学成分类似，既然自然变化可以引起海水的潮汐效应，当然也会引起人体组织液的潮汐效应，这样一来，人与自然的关系便发现了。
大量事实也证明，月相的变化和疾病有着密切的对应关系。这是因为引力的周期变化可以打断水分子中的氢键，使水分子中的一个氢原子失去一个电子从分子中游离出来，成为自由氢质子这种活化能量。人体除了70%的水就是30%的有机物，它们都是靠氢键连接起来的，最怕自由氢质子的破坏，如果组织液中的自由氢质子多了，氢键断裂，有机物就会不断分解，从而引发细胞变异。
同理，整体与局部没有关系吗？生物之所以存在，是因为液态水的存在，水中包含着一种特殊的普遍联系方式，即依赖自由氢质子在水分子链上的快速递进，通过包络在无机离子周围有序水层的周期组织与离散传递能量。人体就是靠这种普遍联系方式把组成人体的每一个细胞统一起来，按照同一目标进行运动。由此可见，如果整体秩序井然，局部细胞都听整体的话，是整体的一个缩影，此时人体是不会生病的，只有整体的管理乱了，局部细胞才能够脱离整体的控制，实现自由变异。因此，中医把整体的管理失控看成是疾病的原因。
有人可能会问了，精密仪器的观察难道不如哲学的思辨对万物认识更准吗？答案是肯定的。
首先，如果万物归一，那么组成精密仪器的物质和所有被观测的物质本质上就是一样的，用它只能观测由统一物质组织起来并出现个性的东西，而对共性的统一物质的混沌状态是永远不可观察的。而西方科学所依赖的精密仪器正是这个原因，才忽视了连续在空间中的统一物质以及它的不对称运动，这样一来，人与自然的关系就被割裂了。其实，人是在反抗自然的不对称变化中存在的，反抗能量的产生是人体运动最主要的能量来源，食物只是用来补充那30%的有机物的，而不是补充能量。试想，如果连人体的能量来源都搞错了，这个医学能可靠吗？
其次，组成精密仪器的原子是标准的物质系统，它和秩序存在依赖于空间的变化，或者说，它的变化和空间的变化是同步的。如果用它来观察周围的世界，就象站在运动的火车上看火车上的东西是静止的一样，其实，万物都是在不对称变化中存在的。最典型的例子就是对引力的测量，根据平方反比的引力公式，随着日地、月地距离的变化，地球上任何一点的引力肯定是周期变化的，可精密仪器却测不出来这种变化，根源就在于它和引力变化同步。
显然，精密仪器对世界的观察并不客观，如果我们认为精密仪器观察到的世界就是真的，那一定会闹出大笑话的，而西医就是这样一个笑话。它不仅忽视了人与自然的关系，而且忽视了整体与局部的关系，从而把疾病的原因单调地归于局部细胞病变之上。但事实上，细胞都是依赖组织液而活着的，它的力量与整体的力量相比是微不足道的，它之所以病变，根本不是细胞的原因，而是它所依赖生存的环境出了问题，逼着它不得不变异。西医对病因的认识就错了，当然治疗方法就是错的。
而我们中医呢？则是根据整体决定局部的系统学规律，用恢复整体管理的办法来治所有病的，因为只要整体的管理恢复了，局部病变细胞就会在整体力量的控制下改邪归正，中医就是一门恢复人体管理的学问。
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