中医和西医是基于两个完全不同的科学体系而产生的，但当今的世界只认可西方科学，却不认可东方科学。原因很简单，东方科学的理论框架仍然停留在几千年前，现代人无法理解。中医要想征服世界，就必须使东方科学现代化，让每一个人都认识到它存在的价值。
当然，现代人无法理解东方科学的另外一个原因就是东西方科学前提假设上的巨大差异。西方科学的前提假设是原子说，它用少数几个基本粒子的不同组合来解释整个世界；东方科学的前提假设是气一元论，它用统一的一种物质（气）的有序（聚）和无序（散）变换的规律来解释自然界的一切。不可否认，在古希腊，也有类似的思想，如赫拉克利特就用生命之火的燃起与熄灭来解释自然界的一切。不过，西方科学却是在原子说假设之上发展起来的，它以对万物不断的还原为基础，建立了一个庞大的科学体系。
很多人不知道前提假设对科学的重要性。举一个例子就知道了，以对光的认识为例，如果站在以太观的假设之上，光就是媒介波，即同一种媒介的周期运动，如果否定了以太观假设，光就只可能是子弹一样的粒子运动。也就是说，前提假设不同，由此得出的认识也完全不同。东西方科学的差异就在于此，站在原子说假设之上，就必然会认为，只要挖掘出了那几个基本粒子，自然规律就找到了，西方科学就是走在这条还原分析的大道上。而站在气一元论假设之上，万物分解到最后都是同一种叫不出名字的东西，还原分析没有一点意义，真正的自然规律只可能是物质的组织原理，或者说系统的发展规律，要正确地认识它，只有一种方法，那就是哲学的思辨，东方科学就是走上这条思辨的大道上。
当然，东西方科学各有所长，因为认识自然的方法有两种，一种是哲学的思辨，一种是科学的观察，哲学可以为科学提出原理，指明科学发展的方向，而科学则可以验证这个原理并为新原理的提出提供新的依据，两者是相辅相成、缺一不可的。可是，在东西方科学发展的过程中，两者一直是分道扬镳的，首先是东方科学，它过于执迷于哲学的思辨，而忽视了科学手段对它的检验与提高，致使它思辩出的原理仍然停留在几千年前，至今无人能识；之后则是西方科学，它过于迷信精密仪器，而忽视了精密仪器观察不到的物质世界，造成了科学在发展上的畸形。
西方科学解释不了中医，并不是中医不科学，而是中医是建立在东方的系统科学之上的，而西医是建立在西方还原分析的科学之上的。就拿对病因的认识来说吧，科学家们所依赖的精密仪器一是观察不到人与自然的关系，二是观察不到整体与局部的关系，最终只观察到了细胞病变与疾病的某种对应性，于是就相当然地认为细胞病变是疾病的原因。而东方科学对病因的认识则来自于系统间的类比，如人体系统与地球系统之间的类比，自然变化主要是通过作用于地球上的水来影响地球的（潮汐效应），类比到人，自然变化也主要是通过作用于人体的水来影响人体的（生理周期），中医由此得出了人顺应自然则生，违背自然则死，疾病就是人与自然矛盾激化的产物；地球上的能量循环主要是水循环，类比到人，人体的能量循环也应该是水循环，经络学说就是对以水为基础的普遍联系方式的一种高度概括，中医由此得出了一切疾病都是由不平衡引起的整体管理失控造成的，只要恢复了整体的管理，疾病就会在整体力量的控制下走向好转，而中医就是一门恢复人体管理的学问。
显然，要想使中医现代化，就必须帮助现代人正确认识人与自然的关系，以及整体与局部的关系，这靠现有西方科学的精密仪器是做不到的。要正确地认识这种关系，就必须在气一元论的基础上重建西方的系统科学，从而形成一个一个完整的系统科学体系，这样一来，我们就可以轻松地认识到整体与局部的关系，进而认识到中医的科学性。
当然，只有理论是不够的，因为我们无法判断这个理论是否更接近自然的实际。证明理论的方法有两个，一个是理论上的自恰，即用它可以合理地解释现有的自然现象；一个是实验上的证明，即根据理论推论出未知的自然现象，并从实验上加以反证。
中医要想征服世界，理论上的自恰是必不可少的，即用这个全新的系统科学体系可以全面的解释中医理论；科学上的实验也必不可少，只要理论正确，它一定能够更深刻地认识人体，进而推导出未知的人体现象，如经络本质，中药药理，神经冲动的原理，意识产生的原理，气功外气和特异辐射的本质，如果我们能够从实验上来证明它们，那么就可以反证这个理论才是更科学的。
西方人可以不相信新的理论，但它一定会相信可重复的科学实验，只要我们能够做出来这些实验，就可以让所有西方人心服口服。就拿经络路线来说吧！西医观察不到就不承认它的存在，如果你了解了经络的本质，就能够清楚地知道，经络是人体组织液的循环通道，西医观察不到并不是它不存在，而是解剖方法造成了组织液的流失，使这些组织间隙观察不到罢了。要想观察到经络路线，就只有在组织液充盈的时候进行观察，或者把组织液闪冻到其中，此时再用解剖方法，就可以清晰地观察到这些组织液的循环通道，它和经络学说中描述的经络路线一模一样。这时，就直接证明了经络学说的科学性，无人再去否定。
现在的当务之急是把中医学中隐藏的系统科学体系完整地揭示出来，并用它来证明中医的科学性，更重要的是，我们还可以用这个理论帮助我们更深刻地认识那些精密仪器观察不到的物质运动，进而从实验上加以证明，推动中医突破性进展。
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