这项研究结果提供了有关RNA引导Cpf1切割DNA机制的一些新见解,为合理设计建造CRISPR-Cpf1工具箱建立了一个框架。
来自Broad研究所、东京大学的研究人员,在新研究中揭示出了Cpf1/向导RNA/靶DNA复合物的晶体结构。这一重要的研究成果发布在4月21日的《细胞》(Cell)杂志上。
Broad研究所核心成员张锋(Feng Zhang)博士及东京大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nureki教授是这篇论文的共同通讯作者。张锋博士是近几年大热的CRISPR/Cas9技术的先驱开创者之一。2013年,这位80后的年轻华人科学家开发出了可用来编辑DNA、敲除指定基因的CRISPR/Cas系统,自此之后一直致力于推动这一技术走向完美。
在2015年发表于Cell杂志上的一项研究中,张锋及其同事们报告称发现了一种不同的CRISPR系统:CRISPR–Cpf1,其有潜力实现更简单、更精确的基因组工程操作。他们描述了这一新系统一些出乎意外的生物学特征,证实可以操控它来编辑人类细胞基因组。与Cas9相似,Cpf1可以被重编程通过与向导RNA的互补性来靶向DNA位点。但Cpf1具有一些不同于Cas9的独特特征,有可能大大扩充基因组编辑的工具箱。
为了阐明Cpf1识别和切割靶DNA的机制,在这篇Cell文章中研究人员报告称确定了氨基酸球菌属(Acidaminococcus sp)Cpf1 (AsCpf1)与向导RNA和靶DNA复合物的晶体结构,分辨率达到2.8 埃(?)。AsCpf1采用了一种二裂片(bilobed)结构,RNA-DNA异源双链核酸分子束缚在中间通道内。他们通过比较AsCpf1和Cas9的结构,揭示出一些惊人的相似性和主要的差异,由此解释了它们独特的功能。AsCpf1包含RuvC结构域和一个推定的新核酸酶结构域,它们分别负责切割非靶向及靶向DNA链,由此生成交错的DNA双链断裂。AsCpf1借助了一些碱基和形状读取机制来识别5′-TTTN-3′PAM。
这些研究结果提供了有关RNA引导Cpf1切割DNA机制的一些新见解,为合理设计建造CRISPR-Cpf1工具箱建立了一个框架。
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