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不止真相| 奥密克戎的名字,骗过了谁?

写在前面:本文不能保证绝对的客观和中立,但可以保证绝对的无利益相关。

前言

       真相不是部分事实,而是所有事实的总和。一年以来,我们对奥密克戎的真相尚未熟悉,便要匆匆与其“共存”,“对抗”。在这个时代,每个人都是自己的健康责任第一人。我们忍不住发问“奥密克戎,你是谁?”

    知道的越多,恐惧的越少。本文旨在通过跟踪和梳理《柳叶刀》《Variant report》《RKI》等顶尖期刊、机构、媒体最新的文章和研究数据,进行总结和归纳,让我们跟上奥密克戎变异的脚步,揭开奥密克戎的神秘面纱。

    本文为跨专业人士书写,文章数据和研究结果均来源于各大权威期刊、机构、媒体,尽可能做到交叉验证。考虑到病毒变异带来的研究前沿性,本文内容可能存在纰漏、错误、谬论。如有相关意见,欢迎随时指出,我们会在研究后,对文章进行修改,并感谢您对厘清新冠公众认知所做出的贡献。最后,本文在此对奋战在第一线的医疗工作者和科研人员致以最崇高的敬意。

       本篇为本文系列第一篇,旨在对奥密克戎家族的命名规则进行分类梳理,本文所引用的参考文献均在文末列出,如有疑问或建议,欢迎在后台指出。

命名

          什么是奥密克戎?

      我们常说的Omicron,还有以往的Alpha、Beta、Gamma、Delta等等都属于世卫标签(即WHO label)[1]。这种分类方便记忆,且有益于刨除地域民族政治偏见,但这种分类将同一系列的病毒称之为某个希腊字母变异株,而这种分类并不“均等”,即这些变种之间的区别(主要是演化距离和突变程度)无法被合理展示,故如今只得调用PANGO命名以示区别。

     如图一所示,倘若原始株的B.1被命名为Alpha,则现如今所有突变株仍被称为Alpha,这便是WHO Label命名法存在的巨大缺陷。(即过于关注某个VOC(值得注意的突变株,要求产生较大范围内的大流行)变种,导致对这个突变节点后的VOC无法再命名。(主要还是WHO摆烂了))

(图源CoVariants。只有箭头所示节点的父节点以上或其兄弟节点(和其子节点)发出的变异株,才会给予新的希腊字母命名,例如XBB虽为重组毒株,但其重组两者均为Omicron变异株,故仍为Omicron)

        而近期经常见到的,北方流行的BF.7和南方流行的BA.5等,都是PANGO命名标准下的产物。[2]

     什么是PANGO命名标准:  PANGO命名系统由两个委员会负责规则的制定和具体命名的认定。委员会的成员为来自世界各地的传染病学和生物信息学等相关专业的研究人员。数据来源是世界各地监测到的新冠病毒全基因组测序数据。该命名标准会对所有产生值得关注的变异株进行命名,但由于Omicron变异株过多,所以未产生如一定有效变异的变异株不会被列入统计范畴。(笔者注:也就是儿子不像爹了,女儿不像妈了,那得赶紧记一记。)如想确定每种变异株的命名,可以调用GISAID命名规则。

(以下为对PANGO命名法规制的简单介绍,可以跳过:

       PANGO命名法,毒株全称一般都以大写字母A和B开头,并后接点号“.”和数字的形式记录。前面的英文字母代表属于某一个支系,后面的点和数字代表来源于前面支系的第几个子代分支。如以B.1.1.7为例,B.1.1.7是B.1.1支系的第七个子代支系。Pango命名法将谱系名称限制在最多四个层次的祖先,以确保谱系名称不会过长,当某一个支系后面的数字超过3个时,将产生一个新的字母支系。如B.1.1.1的下一个子代支系不叫B.1.1.1.1,而是生成一个新的支系C支系,命名为C1;在巴西传播的关切变异株被称为P.1,而不是B.1.1.28.1。在这其中,A和B表示最早测序获得的两个原始株序列。Pango命名能清楚表示出该突变株在进化上位置,以及和其他突变株的亲缘关系的远近。

      不过,凡事皆有例外,在这之中,重组毒株以字母X开头命名,代表重组,其他也按照字母顺序,根据演变的母系和支系命名为XA/XB... ,随后继之以XAA,XAB...,XBA,XBB...以此类推。[3]

     最后,值得注意和具有现实意义的是,所属Omicron的变异株如图一所示,均属于B1.1.529的分支,演化出非常长的分支和家族。

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