前面肥水篇主讲肥的分类和应用，其实肥水一般都是搭配菌来应用，益生菌可以将水体中不利于藻类直接吸收的大分子物质分解成藻类可直接吸收的小分子物质，益生菌的分解产物也能起到一定的肥水的作用，整体来说大部分益生菌是有利于肥水的。水产上常见得益生菌也多种多样，主要为
①芽孢菌：特点分解能力强，适用于塘底淤泥等有机质多的池塘，也可以搭配光合菌来进行净水作用。
②光合菌：主要是利用光合细菌“固氮”作用去除水体中的氮源，及其进行光合作用时以硫化氢作为供氢体，可以达到去除硫化氢的作用。整体而言，光合菌适合在中后期净水时使用，不适合肥水用，因为其固氮作用，可以理解为其营养源和藻类的营养源相冲突，故不利于肥水。光合菌适合于中后期净水，因为中后期随着投饵的增多，氮源的积累会过多易造成藻类过旺、水色过浓，硫化氢及氨氮等有害物质积累过多，光合菌是个不错的选择。
③EM菌：以光合细菌、乳酸菌、酵母菌和放线菌等为主的10个属 80余个微生物复合而成的一 种微生活菌制剂，属于复合型的细菌，菌种丰富，肥水首选，因为不管池塘的水质、土质如何，其中一种或多种益生菌能适应不同的环境存活繁殖起来的可能性更大。EM的营养源多元化，主要以碳源为主，与藻类的营养源形成直接竞争相对比较低（生产上一般添加糖作为碳源）。如果说芽孢菌分解能力强的特点像特种部队，单一功能强大，但是战场空间较小。那么EM就是多兵种协作的集团军，更能适应不同的战场及规模化作战，所以EM不单是肥水首选，还可以作为中后期的调水使用已及拌料内服。
④硝化菌：主要用于降解亚硝酸盐，特点：繁殖速度慢，很难竞争得过其它细菌在水体里面形成优势种群。
⑤乳酸菌：能够将碳水化合物发酵成乳酸，因而得名。在水产上单一应用较少，主要用于内服改善虾的肠道。
⑥酵母菌：属于兼性厌氧菌，在水产上应用较少，个别养户用于内服改善鱼、虾的肠道。其它益生菌……略
养殖中常见的活菌使用误区（起码是虾工经常见到的误区）
①芽孢菌浸泡时间过长。虾工经常在塘边见到一大盘泡好的东东，塘主还美名其曰：浸泡一天两天先活化活化。甚至告诉虾工，先扩大培养，再投到塘里面……每当看到这样的场景，虾工都会疑惑：你将那么多菌泡在一个那么狭小的空间里叫活化？是想整死它们吧……还好意思说扩大培养，就那条件，你泡在那几十升的空间里面、氧气不足、空间有限、载体发酵发热、表面风干脱水、杂菌污染等等不利条件下凭什么比投进塘里面更容易活化更容易繁殖？塘里面那么大的空间、那么丰富的营养源那样不完爆你那小盘小桶的？还有虾药厂业务员跟我来上一套什么好氧、厌氧的高大上理论的，狡辩什么厌氧型的菌不需要氧气可以长时间泡，你确定你泡的菌都是厌氧的？就算全部厌氧的，你确定它们工作的时候厌氧，分裂、繁殖的时候也厌氧？！…….虾工前面讲到肥时曾说过放菌与肥一起泡，那是放少量的菌，起发酵的作用，发酵完成后鬼知道是有害菌还是有益菌占优势啊,所以利用那点菌完成发酵之后就用生石灰消毒过后才安心啊……很多的芽胞菌包装袋上都建议浸泡12小时甚至24小时再投入池塘效果更佳……对这些厂家我只想问:你确定你还有节操么……
②用光合菌肥水。我们使用光合菌主要是利用光合细菌的“固氮”作用去除水体中的氮源，及其进行光合作用时以硫化氢作为供氢体，可以达到去除有害硫化氢的作用。整体而言，光合菌适合在中后期净水时使用，不适合肥水用，因为其固氮作用，可以理解为其营养源和藻类的营养源相冲突，故不利于肥水。虾工曾看到有的光合菌产品名就叫 “肥水光合菌”的，能叫这种名字的不是厂家产品有多强大，而是厂家的内心足够强大……
③活菌与消毒剂、氧化剂一起使用。消毒剂与氧化剂都有一定的杀菌或抑制细菌繁殖的作用，使用要错开时间……至于要错开多长时间，取决于不同类消毒药与氧化剂的药效强弱、时长，有机会虾工再另外开贴探讨……最奇葩的一次经历是虾工曾见过虾农将EM菌和大蒜汁一起拌料来内服的，虾工当时就给跪了…….（篇幅所限、未完待续）
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