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Nature论文中的三维图原来是这么画的

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教程内容

效果展示

先上一个效果展示图,符合你的预期再往下看

图1 Nature Comms.(10.1038/s41467-020-15062-w)论文中的图1用GMT绘制的效果

绘图过程简介

GMT绘图复杂组合图,建议采用先拆分后组合的策略!

Figure1(a,b)

这是两个二维图,完全没有难度,直接上图。

Figure 1 (a)

Figure 1 (b)

Figure1(c)

海底地形三维立体图+三维散点,这个必须使用我修复bug之后的gmt才能画出这种效果,所需要的所有程序都在docker镜像里面。只需简单的三个命令就可以使用,完全无压力!

Figure1(d)

海底地形三维立体图+三维散点+切片数据+切片投点和曲线,这个必须使用我修复bug之后的gmt才能画出这种效果,所需要的所有程序都在docker镜像里面。只需简单的三个命令就可以使用,完全无压力!

最终组合

图1的最主要的四个子图,每一个都能够单独绘制,然后将其进行组合布局。因为gmt不是一个所见即所得的绘图软件,所以为了更方便的设置每个子图的位置,可以通过一个A4纸大小的网格作为辅助底图进行布局调整。

三小时高清精讲视频和全部绘图代码

如果想看全部的视频和绘图代码,请点击文末的【了解更多】按钮。

图1的不完整绘图代码示例

总共两百行代码就可搞定上面的三维+二维组合图

function preset(){    path_data=../../data/raw    bathy=${path_data}/bathy/bathy_Longqi_cart.nc    basalt=${path_data}/sites/site_basalt_cart_zhao_bathy.txt    # 数据范围    zmin=-6    zmax=-1.5    zrange=$zmin/$zmax    xmin=-18.35    xmax=33.35    ymin=-29.9826    ymax=11.653     range=$xmin/$xmax/$ymin/$ymax     range_xyz=${range}/$zrange    xmin_eq=0    xmax_eq=20    ymin_eq=-10    range_xyz_eq=$xmin_eq/$xmax_eq/$ymin_eq/$ymax_eq/$zmin_eq/$zmax_eq    # 视角    angle_h=-40     angle_v=45    angle_view=${angle_h}/$angle_v    # 图片大小    width_x_fig=8}gmt begin Figure1 pdf     # (a)    move_x=0    move_y=12    # gmt basemap -JM$figwidth_inset -R$range_inset -Bwsen  --MAP_FRAME_TYPE=plain    # gmt basemap     gmt coast -Ggray -JL$lon0_inst/$lat0_inst/$lat_min_inset/$l    gmt grdcontour $bathy_AUV -C0.02 -A+f3p,Helvetica+ggreen -W0.2p -GD500e -p    # 采样点    symbol_sample=c    gmt psxy $path_data/sites/M-active.txt -S$symbol_sample$si    # legend    # (d)    move_x=-1    move_y=-4    gmt basemap -JX$width_x_fig_eq/$width_y_fig_eq -JZ$width_z    gmt grdview $bathy -JZ -p -C$bathy_cpt  -N${zmin_eq}+g$color_profile -Qi -I0+a45 -Wf0.5p,black    awk '{print $1/1000.0, $2/1000.0}' $earthquake  | gmt grdtrack -G$bathy | gmt psxyz -JZ -p -Sc$size_eq -Ggreen -Wblack    # 东西方向    gmt basemap -JX$width_x_fig_eq/$width_z_fig_eq -JZ$width_y_# boundary between title and legend# symbol space legend type length (-) thickness,color space LegendName# N 3H 10p Helvetica Legend of figure (c)N 2G ${gap_rows}cS        ${left_symbol}c   a      0.3c            $color_active 0.2p,$color_active       ${symbol_text}c  Active hydrothermal fieldS        1c   c      ${size_symbol}c            $color_basalt 0gmt endrm tmp* gmt.history box.eq 
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