Science| 美研究人员发现垃圾DNA中串联重复序列成为基因调控新“目标”

近日斯坦福大学遗传学系科研人员在Science发表了题为《短串联重复序列与转录因子结合，调整真核基因的表达》论文，该研究讲述了短串联重复序列(Short tandem repeats,STRs)在调控基因表达中的重要作用。

STRs广泛存在于真核生物基因组的调控元件中,STRs长度的变化往往与转录水平的改变相关。但是STRs调控基因表达的具体机制一直不明。

Horton等在研究中发现,许多转录因子可以直接与STRs结合,而这种结合无需类似已知的结合位点,可以用简单的加性模型解释和预测,即重复的低亲和力结合位点之和产生较大作用。

结果表明,STRs提供了一种调节转录因子结合和下游基因表达水平的调控机制。STRs约占人类基因组的5%,而编码蛋白的基因仅占1.5%,STRs长度变异与许多疾病相关。

结论是,大约90%的真核生物转录因子优先与某种STRs结合。由于STRs高度可变,应将其视为一类易于进化的顺式调控元件。优选的STRs不一定类似已知的结合位点,这说明STRs可以招募转录因子拷贝数调控不同的靶基因。

STRs可以看作一种调节本地转录因子浓度和结合反应的调节器,在疾病、发育和稳态中调节基因表达。

来源：

https://www.science.org/doi/10.1126/science.add1250

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