众所周知，miRNA靶向mRNA中的3'UTR区，从而在转录后水平沉默基因表达。也有一些研究表明了miRNA有靶向蛋白质编码序列（CDS区）的能力，然而，一般认为miRNA通过类似机制发挥作用，而不管其作用位点的位置如何。
近日，Nature子刊Nature Structural & Molecular Biology（IF=13.333）发表来自武汉大学生科院付向东、周宇团队的题为：A novel class of microRNA-recognition elements that function only within open reading frames 的研究论文。该研究发现了一类新型miRNA识别元件（MRE），它们仅在CDS区域起作用，miRNA通过靶向这些CDS MRE，并通过诱导瞬时核糖体停滞而不是mRNA去稳定化来抑制翻译。这些发现揭示了靶向CDS区的miRNA与靶向3'UTR的miRNA，对翻译的抑制是通过两种不同的机制实现的。
miRNA介导的mRNA衰变的机制已被很好地阐明：RNA诱导沉默复合体(RISC)最初募集GW182，其反过来吸引脱乙酰酶和脱乙酰酶复合物；这些复合物使mRNA末端脱保护，从而通过5'-3'和3'-5'RNA核酸外切酶导致mRNA衰变。
目前已经提出许多不同的机制来解释miRNA介导的翻译抑制，然而这些机制都尚未得到证实。
之前的研究也有发现位于CDS区的MRE，但它们置于3'UTR区也依然发挥作用，这与之前的miRNA通过靶向3'UTR区的作用机制是一致的。
而此次则是发现了一种只在CDS区起作用的MRE，移动到3'UTR区就丧失功能。靶向CDS区的miRNA的功能依赖于Ago而不是GW182或其旁系同源物，因此可能存在一种独特的机制以解释它们对翻译的影响。
靶向CDS区的miRNA可能使用与翻译质量控制相关的机制，其主要特点是不间断衰变（non-stop decay）途径。该机制似乎也在CDS中间起作用以响应tRNA加载缺陷，其导致强核糖体停滞而不是mRNA衰变。内部核糖体停滞可能最终传递影响翻译中受影响的mRNA的整体能力的信号。
总的来说，这项研究发现并证实了一类新型的miRNA识别元件，它们仅在CDS区域起作用，通过诱导瞬时核糖体停滞而不是mRNA去稳定化来抑制翻译，提出了miRNA对基因调控的可能的新的作用机制，也扩展了miRNA对基因调控的认知。
付向东教授、周宇教授为共同通讯作者为，Kai Zhang、Xiaorong Zhang、Zhiqiang Cai、Jie Zhou为共同第一作者。
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