课题中，最常见的研究对象就是基因，而筛选那些有“研究价值”的基因就是首要目标，即哪些基因是影响患者预后的。因为确定了基因，就可以顺藤摸瓜确定参与的信号通路，所以这一步至关重要！
比如你们实验室是研究乳腺癌的，那如何筛选所有和乳腺癌预后有关的基因呢？
不可能一个个去做实验吧，当然不用，利用生物信息学筛选就行，你也不用学代码，使用下面提到的预后批量分析工具，在线鼠标点点，就能批量分析20000 个基因（相当于全基因组啦）对疾病预后的影响！
第一步：进入官网首页www.aclbi.com，直接选择“批量分析”工具。
第二步，样本库从左侧选择33种的TCGA数据库的肿瘤类型中获取样本，然后就可以点击Plot啦。
如上图，结果以森林图的形式展示，p值小于0.05就是对预后有意义了，HR小于1就是保护因素，大于1，那就说明是危害因素，所有有统计学意义的结果都会展示出来，一目了然！结果可以下载高清图，也可以下载对应的原始数据，底部就是所有的方法学的写作方法和结果的写法，参考文献，太贴心了
当然，你可以对某些样本进行亚组筛选，比如选择三阴性乳腺癌，比如抽烟的肺癌样本，EGFR突变的样本等等。
根据以上结果，从中挑选出一些某个肿瘤预后相关基因之后，就可以借鉴单基因分析套路将它丰富起来，如从表达层面，表观层面，蛋白层面，突变层面，免疫层面等多角度多数据联合分析哦
也可以确定某个基因，尝试批量相关性分析，找到有哪些基因可能跟这个基因较为相似，进而另外一篇单基因的课题就出炉啦
确定了基因，相当于抓住了课题的主线，就可以敲减这个基因，差异基因，挖掘差异通路，基因，信号通路，表型这三个课题三要素就有了，心里不慌了吧？
你可能会问，差异基因是不是要花钱测序呀？
不用！还是用这个神器，直接使用“差异基因分析”功能就行了！
样本筛选表里，输入目标基因，就可以筛选出样本高表达和低表达的样本啦（这里提供了2种方法，高低50%和高低25%，都可以试试哦）然后就可以直接使用差异基因功能分析啦
收工！
没花1分钱，热图，火山图，信号通路富集图，生存预后图，都拿到了，基因确定，信号通路确定，课题总该有底了吧
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