美国达特茅斯学院Norris Cotton癌症中心的研究人员利用先进的分子生物学和统计学方法，发现了两种不同DNA修饰在胶质母细胞瘤（GBM）组织中重要作用，其中一种特殊的修饰形式：5hmC，与癌症患者存活率密切相关。
(Brock Christensen博士)
这一研究成果公布在11月21日Nature Communications杂志上，领导这一研究的是达特茅斯学院Brock Christensen博士，他与其他同事打破了原有局限，通过对多个DNA修饰的分析，获得了这一重要的发现。
胶质母细胞瘤（Glioblastoma ,GBM）是颅内常见的恶性肿瘤之一，有报道称占颅内肿瘤的10.2%，仅次于星形胶质细胞瘤而居第二位。胶质母细胞瘤恶性程度高，术后易复发，一般常在8个月之内，生存时间平均1年，个别可达2年，是危害人类健康的重要疾病之一。
GBM一种重要的分子特征就是出现了错误的表观调控，表观基因组学指的就是指导基因关闭或开启的DNA修饰，科学家们发现一些表观缺陷会引发癌症，而且目前预测脑癌患者预后的方法也是基于表观肿瘤亚型。然而，表观基因组学十分复杂，而且目前仍然缺乏关于胶质母细胞瘤中的表观遗传标志。
在这篇文章中，Christensen等人在一组30个胶质母细胞瘤样品中，分析了包括5-甲基胞嘧啶（5mC）和5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）在内的多个DNA修饰，“健康个体与疾病患者体内不同DNA修饰详细功能，引发了大家的关注。在这篇文章中，我们揭示了胶质母细胞瘤中特殊的DNA 5mC和5hmC模式，以及基因组中被称为‘增强子’的分子开关的特殊特征。而且更重要的是，我们发现 5hmC 与患者存活率之间的重要关系，”Christensen说。
之前的技术局限性限制了研究人员，无法同时高分辨率分析癌症基因组中的5mC 和5hmC 水平。这项新研究利用先进的分子生物学和统计学方法，比如他们的Discovery Computing Cluster 和 Nano String nCounter，分析了基因组关键区域中的DNA修饰水平。
“结合这些方法，我们发现了表观基因组对癌症的更多影响，以及5hmC不同的功能作用，”Christensen说。
这是第一次在胶质母细胞瘤基因组中发现5hmC的作用，以及5hmC与癌症患者存活率之间的关联。展望未来，这些结果指出表观基因组学将在脑癌未来预后与治疗方法发挥更大的作用。
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