RNA修饰研究有助表观转录组学进一步发展 | 热点

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随着科研人员逐渐揭开RNA修饰的奥秘，帮助我们了解表观转录组学（epitranscriptomics）的工具也变得越来越多了。

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2004年，以色列特拉维夫大学（Tel Aviv University in Israel）的肿瘤学家Gideon Rechavi等人将当时能够找到的所有人类基因组DNA序列与对应的mRNA进行了比对。他们希望找到mRNA序列里的腺嘌呤（adenosine, A）转换成次黄嘌呤（inosine, I）的信号。这种A到I的转换会改变蛋白质的编码序列，对于我们人类而言，这是保证天然免疫系统正常功能的关键因素。据Rechavi回忆，这项工作听起来简单，但实际上非常复杂。好多个研究小组都曾作出尝试，但结果都以失败告终。这主要是因为当时的测序技术还不太发达，会产生很多错误的测序结果，比如单碱基突变结果，进而带来了很大的数据噪声。但是Rechavi等人使用了新的生物信息学工具，所以成功地在转录组中发现了数千个A—I转换位点，而一个细胞，或者物种的所有mRNA其实也就这么多。后续的研究又陆续将这些A—I转换位点的数量增加到了数百万个。