零基础PubMed检索七分钟入门

第一分钟：PubMed是什么？

答：①PubMed是一种常用的文摘型生物医学文献数据库；②PubMed收录学科范围主要为生物医学与健康，也包括部分的生命科学、行为科学、化学、生物工程等领域；③PubMed由美国国家生物技术中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）、美国国立医学图书馆（National Library Of Medicine，NLM）和美国国家卫生研究院（ National Institutes of Health，NIH）提供；④PubMed引文的主要来源为：MEDLINE、生命科学杂志和在线书籍；⑤PubMed的网址为：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 。

第二分钟：PubMed为什么成为生物医学工作者最常用的数据库？

答：①文献范围广、收录量大，截止到2015年底，PubMed已经收录了25,000,000篇引文；②免费，一台电脑接上因特网即可检索；③界面友好，操作方便，带有自动检索匹配技术。

第三分钟：PubMed的初始页面是什么意思？

答:

1. LOGO为NCBI的标识，点击可以进入NCBI主页；

2. 资源（Resources）：可链接进入NCBI的其它数据库；

3. 使用指南（How to）：点击可进入Pubmed的使用指南；

4. 检索库：默认为“PubMed”，也可选择其它库，比如我们在《如何找到英文期刊的投稿网址？》一文中选择的就是“NLM Catalog”这个库；

5. 检索框：在其中键入检索词；

6. 高级检索：适合分步骤的、复杂的检索；

7. 检索键：输入检索词之后点击该键可执行检索命令；

8. 注册用户名：注册用户登陆后可显示用户注册名。建议使用PubMed的同学都进行注册；

9. 退出登录（Sign Out）；

10. 教程与使用指南（Using PubMed）：提供了PubMed的快速使用指南、全文库、常见问题、教程等；

11. PubMed工具（PubMed Tools）：提供了PubMed的一些特制检索；

12. 其它资源：链接的NCBI其它数据库，包括MeSH词库、期刊库、临床试验库等等；

13. 论坛（PubMed Commons）：是PubMed的论坛，读者可对Pubmed中的文献进行评论。

图1. Pubmed的初始页面

第四分钟：怎样进行基本检索？

答：

1. 初步检索：

PubMed的初步检索很简单，只需把检索词填入检索框中进行检索即可。但是，如果想要提高查全查准率，则需进一步设计检索式或者进行高级检索（Advanced）。举例，若要查高流量鼻导管吸氧治疗急性呼吸衰竭的相关文献。检索词为高流量鼻导管吸氧（high-flow nasal cannula oxygen）、急性呼吸衰竭（acute respiratory failure），将“high-flow nasal cannula oxygen acute respiratory failure”敲入检索框即可检索出相应文献（图2）。需要注意的是在检索结果的右下角有search details对话框，提供的是PubMed特有的词汇自动匹配技术所自动产生的检索式，通过调整此检索式可以进步调整检索结果（具体会在后续文章中介绍）。

图2. 高流量鼻导管吸氧治疗急性呼吸衰竭的简单检索结果

2. 作者检索：

PubMed中作者检索的常用规则有两种检索方法：1.用作者全名进行检索；2.用作者lastname（姓）+名字的首字母。仍以Zhi-De Hu为例，进行这两种检索，得出图3。姓名的 检索结果可能会有所出入，因为存在着重名的情况。针对重名情况，学术界已经开始逐渐采用作者ID，目前Web of Science正在做。

图3.姓名检索。A.全名检索，B.姓+名缩写检索。

3. 杂志名检索：

以Annals of Translational Medicine（ATM）检索为例。最简单的方法是将杂志名“Annals of Translational Medicine”贴入检索框直接进行检索，然而此时得出的自动匹配检索式是：'Ann Transl Med'[Journal] OR 'annals of translational medicine'[All Fields]。在这个检索式中包含两部分，第一部分'Ann Transl Med'[Journal]是ATM杂志名缩写的检索，第二部分：'annals of translational medicine'[All Fields]是该杂志名全拼在所有域中的检索。

此时若想准确限制检索杂志名，可以在Search details栏中将第二部分'annals of translational medicine'[All Fields]删掉再进行检索，或者在Advanced检索中限制检索字段为[Journal]。

第五分钟： 运算符号

常用的布尔逻辑符为AND、OR、NOT。AND代表得到的检索结果符合所有的检索条件，OR表示检索出的检索结果至少符合一条检索条件，NOT表示得到的检索结果排除了符合某一部分的检索条件的文献集。

图4.图示布尔逻辑符。

第六分钟：文章页面的解读（图5）

图5.文献界面解读

第七分钟：扩展——我将走向何处？

初学者知道了前面的内容，基本可以进行初步检索了。然而，PubMed博大精深，很多深入的功能需要进一步挖掘。读者可自行尝试检索。

我们前期已经给大家介绍了：如何利用PubMed查找英文期刊投稿网址、如何追踪PubMed中某领域最新文献、如何打造PubMed专属滤器、如何搞定PubMed文献全文、如何进行临床查询、如何区分PubMed、PMC、Medline等问题……后期我们会更深入介绍MESH检索词、高级检索以及在科研中更加实用的应用技巧，请继续关注。