温室黄瓜在栽培管理过程中常常出现弱棵，畸形瓜，褐斑病，甚至死秧，这些都直接或间接地与根系弱有关。所以，在管理中应采取措施培育发达根系，以达到抗病、增产的目的。
第一，定植前深翻土壤，并施腐熟的有机肥，为根系生长创造良好的土壤环境。深翻土壤25厘米以上，能为黄瓜的生长提供良好的土壤通透条件和营养供应。
第二，定植时可穴施生物菌肥，以菌抑菌，增强黄瓜根部的抗病能力。生物菌肥还有刺激生根的作用，可在黄瓜定植时穴施生物菌肥，以防病促根防死棵。
第三，蹲苗后及时中耕锄划，促根下扎。缓苗后及时蹲苗，以达到壮苗促棵的目的。蹲苗过程中，要中耕锄划2-3次，以改善土壤通透性，确保土壤墒情，引根下扎，培育发达的根系。
第四，黄瓜进入结瓜期，在根系、坐果都不好的情况下，应做到先养根后促果。一是根部灌施生根剂，叶面喷施叶面肥、细胞分裂素；二是使用高氮高钾的冲施肥，这样既可满足黄瓜瓜条生长所需的营养，又可促根壮秧。三是注意协调好结瓜和壮棵的关系。结瓜期及时疏瓜，不要养大瓜、老瓜，尽量不要过多使用激素处理瓜及瓜秧，防止根系早衰，秧苗老化。
第五、护叶 “根靠叶养，叶靠根长”。蔬菜的根系和叶片之间是相互依赖、相互依存、相互促进和缺一不可的关系。蔬菜植株叶子白天在一定温度下，用太阳光照作为动力来进行光合作用制造养分，这些养分一部分向下输送到根部，把根系养好，根系才能生长发育。
黄瓜需要16-20较好的功能叶，才能保证植株正常生长和高产稳产，而有的菜农盲目打掉下部的叶片，有的打叶太狠，造成植株衰弱和产量下降。所以，无故盲目地打叶是十分有害的，尤其是植株下部的叶片，这些叶是有机营养制造的源，是专供这些营养入库即供根利用的。对此，我们要重点保护下部叶片，打叶时要轻，一次不要打的太多。同时，要加强整枝管理，保证合理的株型，改善叶片见光；提高植株抗性，预防病虫害，保证叶片健康，光合作用正常；合理喷用甲壳素等叶面肥，增强叶片内酶的活性，提高光合效率。
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