282个儿科低级和高级胶质瘤的综合基因组分析显示基因组驱动因子，肿瘤突变负荷和超突变特征

　　背景。

　　小儿脑肿瘤是美国癌症患儿死亡的主要原因。纳入儿科低级别（pGGG）和高级别胶质瘤（pHGGs）的新一代测序数据可为诊断，预后和治疗决策提供信息。 

　　材料和方法。

　　我们对282个小儿神经胶质瘤（157个pHGG，125个pLGG）进行了全面的基因组分析，测序了315个癌症相关基因并计算了肿瘤突变负荷（TMB;每兆碱基突变[Mb]）。

　　结果。

　　在pLGG中，我们在95.2％（119/125）的肿瘤中检测到基因组改变（GA）。BRAF最常被改变（48％; 60/125），FGFR1错义（17.6％; 22/125），NF1功能丧失（8.8％; 11/125）和TP53（5.6％; 7/125）突变也检测到了。在35％的pLGG中鉴定出重排，包括KIAA1549-BRAF，QKI-RAF1，FGFR3-TACC3，CEP85L-ROS1和GOPC-ROS1融合。在pHGG中，GA被鉴定为96.8％（152/157）。最频繁突变的基因是TP53（49％; 77/157），H3F3A（37.6％; 59/157），ATRX（24.2％; 38/157），NF1（22.2％; 35/157）和PDGFRA（21.7％; 34/157）。有趣的是，大多数H3F3A突变（81.4％; 35/43）是变体K28M。中线肿瘤分析显示H3F3A突变（40％; 40/100）仅由K28M变体组成。小儿高级别胶质瘤含有致癌EML4-ALK，DGKB-ETV1，ATG7-RAF1和EWSR1-PATZ1融合蛋白。6％（9/157）的pHGG高度突变（TMB>每Mb 20个突变;每Mb范围43-581个突变），对MSH6，MSH2，MLH1，PMS2，POLE和POLD1中的 DNA修复具有有害突变 基因（78％的病例）。

　　结论。

　　小儿胶质瘤的综合基因组分析提供了客观数据，可提高诊断准确性并加强临床决策。此外，TMB可能是识别可能从免疫疗法中受益的儿科胶质母细胞瘤（GBM）患者的生物标志物。

　　对实践的启示。

　　通过提供客观数据来支持诊断，预后和治疗决策，全面的基因组分析对于推进儿科神经肿瘤患者的护理是必要的。我们提出了通过新一代测序分析的最大的儿科低级别和高级别胶质瘤队列。我们在95％的患者中检测到可报告的改变，包括诊断相关的病变以及新的致癌融合和突变。此外，我们报告肿瘤突变负荷（TMB），其鉴定了在DNA修复基因中具有有害突变的超突变胶质母细胞瘤亚群。