内动力地质作用是指由地球内能——放射能、重力能等产生的地质作用，它对黄蜡石的形成表现在以下几个方面：早期形成的岩体（主要是酸性岩，如花岗岩）因构造作用产生裂隙，为后期岩浆或矿液提供了运移的通道和冷凝的空间，许多黄蜡石就是这样形成的。例如云南龙陵黄龙玉就是后期的热液沿花岗岩裂隙充填成矿，矿体受裂隙控制，呈脉状、层状、似层状、扁豆状产出。
岩浆的温度很高，富含挥发成分，又处于高压状态下，因而具有很大的活动性，在与围岩接触时发生复杂的物理、化学反应。例如高温引起的接触热变质作用，产生新的变质矿物（如石英砂岩变为石英岩）。特别在岩浆活动后期，组成岩浆的各组成成分（挥发性成分）按照矿物固有的特性，依次冷凝结晶，形成多种矿物共生组合，如萤石-方解石-黄铁矿-水晶等，这样的石英岩，在表生条件下，共生的矿物往往因风化、搬运而剥蚀、脱落，形成许多有规则的孔洞，这是许多黄蜡石具有格子状、锥状、竹叶状等结构的重要原因，其形状依脱落的矿物而定。构造作用产生的断裂（裂隙）将整个岩体分解为一块块独立的个体，这些石英岩脱离母岩后，坠入山坡、河流中，标志着黄蜡石的形成由内动力地质作用阶段进入了外动力地质作用阶段。从此外力——太阳辐射能、引力能将扮演着改造石英岩的主要角色，最终将一块块石英岩打扮成美轮美奂的黄蜡石。因此在黄蜡石矿藏中有原生矿和次生矿之分。
原生矿是产自岩体中的矿体，次生矿是指脱离母岩的石英岩，在表生作用下，离开原生矿体在异地形成的矿藏。次生矿有三种存在形式：第一种为残坡积型——脱离原生矿体的岩石在地表坡地形成堆积碎屑层，矿石一般具有棱角或保留了其原来破碎的样子；第二种为水系冲积砂矿——在地表的原生矿或残坡积矿石，在重力、水流等作用下，滚落到河流中，经水流的冲蚀搬运，沉积在河床及河流两侧。此类矿藏，因河流的自然分选和磨圆作用，石体圆润、石皮光滑，不少地方称之为“籽料”，是品质最好的蜡石；第三种是因河流改道或地壳抬升等因素，原在河床中的矿石，变成了在地表较高地点堆积形成的矿藏。此类矿藏因河水搬运不远、冲刷较差，因此既有水流磨蚀的痕迹，又保留了原生矿破碎时的形状，许多地方称之为“山流水料”，这种矿石多分布在原生矿床附近的山坡和河流支流。目前随着资源的日渐减少和蜡石雕刻工艺的迅速发展，寻找和开采原生黄蜡石矿的趋势日渐增多，这种原生矿石（“山料”）多为玉髓质地，雕刻的作品晶莹剔透，流光溢彩，已成为黄蜡石收藏、鉴赏的新贵。
