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仙鹤草全体覆盖有白色的柔毛。茎为红棕色，下部为圆柱形，上部为方柱形，四面微微凹陷，多为绿褐色，有纵沟、棱线和节；重量轻，质地硬，容易折断，中空。单鼓羽状复叶为暗绿色，互生，多皱缩卷曲；质地脆，容易破碎；有大小2种叶片，相间生于叶轴上，顶端小叶较大，完整的小叶片展平后为卵形或椭圆形，基部楔形，没有端尖，边缘长有锯齿；有2个斜卵形的托叶，抱茎。总状花序又细又长，花萼下部为筒状，萼筒的上部长有钩刺，花瓣为黄色。仙鹤草气味轻微，有淡淡的苦味。