为了控制船舶营运成本，减少船舶营运支出，船长应注意做好以下工作：
成立船上营运成本控制领导小组，加强营运成本控制宣传和教育，使营运成本控制工作制度化。
尽可能注意节约各种港口使费：
（1）正确掌握船舶进出港时间，争取白天进出港口，以节省引航、拖船和系解缆等费用。
（2）船舶在进出港、过船闸或运河前，尽量调平船舶吃水，以节省引航费的开支。
（3）如与抵达港的有关规定不抵触，并能保证船舶航行和靠离泊的安全，在进出港口时可以考虑自己引领船舶和自行指挥船舶靠离泊位。
（4）在水域、水流、天气允许的情况下，进出港口、过船闸或运河时，尽可能减少使用拖船的艘数和马力数，并尽可能缩短使用拖船的时间。
（5）认真审核每一笔港口使费单证，不签与申报吨位、申报吃水、作业内容、作业地点和作业时间不相符的单证，不签任何空白的单证。
加强与港方、代理、引航等有关方的联系，协调好各方关系，合理安排在港作业的各个环节，以缩短在港时间。在具备电讯卫生检疫条件时，应申请电讯卫生检疫。抵港前，准确预报抵港时间，做好抵港及装卸货准备工作。抵港后，及时递交装卸货准备就绪通知书。在不受水深、能见度、夜航限制的港口，完货后及时开航。
通过轮机长和大副的配合，尽可能减少各种生产性待时，例如：提前备舱，保证在抵装货港前将货舱备好；申请各种特殊作业时准确填报所需的时间；由船方负责装卸时的第一次开舱和最后一次关舱时，应在开工前和完工后及时完成；加油、加水或其他临时检修工作，应力争在装卸货物的同时进行。
督促大副合理地配载货物，尽可能地缩短货物装卸时间，尽可能避免由于配载不当而引起的额外的费用（如困难装卸费用、翻舱费用等）。
根据航区、季节、海流、潮汐、货载、船体强度等情况，设计安全、经济的航线，缩短船舶在海上航行时间。
加强燃油、淡水补给和使用方面的管理，具体措施有：选择价格便宜、质量有保障且港口使费低廉的港口添加燃油、淡水；在开阔水域以及大洋中航行，选用重油或渣油作燃料；在船期允许的情况下，尽可能使用经济航速；利用船舶造水机造水；合理控制淡水日耗量；尽量减少淡水舱室和管系中淡水的跑漏等。
在满足防污要求的前提下，充分利用船上设备自行处理生活垃圾和废油、废水。
加强船体和机械设备的保养，扩大自修，减少厂修，以节约船舶的修理费用。
做好各项迎检工作，保证满足PSC和船旗国检查的要求，使各种检查均能一次性顺利通过，以避免船期的损失。
督促各部门加强物料和备件管理，减少费用支出。除了易损、急需、必备的物料和备件外，能少订的不多订，可订可不订的一律不订，用不到的绝对不订。订购的物料和备件到船后，督促各部门认真核对，避免接收不符合要求和价格不合理的物料和备件。督促各部门长对物料消耗情况进行有效监督，做到不浪费、不丢失、不损坏。
合理地节约船舶通信费用，具体措施有：除非情况紧急，一般情况下不使用卫通电话；能用电传发送的电文不使用传真；发送电文时尽量使用卫通C站等。
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