肠道菌群在促进神经系统发育中起着重要作用。肠道菌群失调可能与下丘脑-垂体-肾上腺轴应激反应异常、脑源性神经营养因子表达下降以及社会行为受损相关。肠道菌群和中枢神经系统均在生命早期迅速成熟，这似乎是肠-脑相互作用的关键时期。
临床研究表明，患有自闭症和精神分裂症的病人肠道菌群发生了改变；然而，正常人类神经发育中的肠-脑关联仍未得到充分的研究。既往研究表明，婴儿气质与肠道菌群组成有关。
近期，《EBioMedicine》上发表的一项纵向队列研究，评估了婴儿期肠道菌群组成与其后续行为结局之间的关系。
研究随机纳入澳大利亚出生队列纵向研究中的201名婴儿，分析了婴儿1、6和12月龄时的粪便微生物群，并在2岁时评估了行为结局。
研究发现，12月龄时收集的粪便样本中普氏菌属的丰度降低与2岁时行为问题（尤其是内在化问题）的增加之间存在显著关联。这种联系似乎独立于多个潜在混杂变量，包括母亲心理健康。近期使用抗生素是普氏菌属减少的最佳预测因子。
综上所述，该研究表明，婴儿期肠道菌群组成与随后的行为结局之间有很强的关联，确定了改善行为问题的潜在微生物靶点，以及可能的影响因素，如抗生素的使用。该研究进一步证实了，婴儿肠道菌群可能对神经发育结局有长期影响，从而影响后期的行为和心理健康结局。
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