该病主要是黄瓜细菌性茎软腐病，即病株的果实和茎蔓等受害部位会流出胶状物，又称‘黄瓜细菌性流胶病’和蔓枯病混发。该病预防效果比较理想，早期防治有一定效果，严重发病后药剂很难控制。
1、种子消毒 种子带菌是该病的主要初侵染源之一，对种子进行消毒处理能够有效避免或者大幅度减轻初始侵害。同时，由于嫁接砧木也能感染此病，故砧木种子也应进行种子消毒。为避免种子消毒技术使用不当影响种子活力，建议在技术人员指导下应用，或者用少量种子先做安全性试验。
2、植物检疫 不购买非法种苗，异地购苗需做好植物检疫手续。
3、无病土育苗 无论是黄瓜还是砧木，最好选用商品已消毒基质育苗；如无适合基质，可用坡地生土或未种过蔬菜的大田土，配置营养土的农家肥应该腐熟且未经蔬菜残体污染。
4、轮作或土壤消毒 优先选取地势干燥，通风排水良好，前茬未种植过瓜类、茄果类蔬菜的地块进行黄瓜栽培。上茬发病棚室的土壤中会留存大量病残体，将成为新茬黄瓜的病菌初始来源。
可在夏季蔬菜换茬期，利用太阳能加有机肥料和秸秆产生高温消毒的办法，进行土壤消毒，能够压低土壤中菌源量。在定植前，按照每亩1千克77%硫酸铜可湿性粉剂的用量，采用拌土的方法均匀撒施于栽植沟内或定植穴内，混土后栽植。
5、农业防治 优先采用高垄覆膜，膜下暗灌的栽培方式，有条件田块应采用滴灌进行灌溉。清洁田园，保持大棚内清洁卫生。门口和过道上撒生石灰，农事操作时穿专用胶鞋。控制田间湿度，缩小昼夜温差。减少田间操作，避免与发病棚串棚走动。连阴寡照天气，或者早上棚室湿度较大、结露较多时，避免或者减少整枝、打杈、绕蔓和采摘等农事操作，利于控制病害在田间的侵染蔓延。
6、药剂防治 在定植时带药定植。利用蘸根的方式用77%硫酸铜钙可湿性粉剂400-500倍液蘸根定植。在发病前期或初期，建议用防治蔓枯药剂（苯甲嘧菌酯，多福溴菌腈等）和防治细菌性病害药剂（铜制剂，可杀得，农用链霉素）一起涂抹，同时对茎叶全株进行喷施处理。
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