1985年5月23日至6月6日，中央军委召开扩大会议，作出裁减军队员额100万的决策。陈仁洪参加这次中央军委扩大会议，讨论贯彻落实军委关于精简整编决策的措施。6月5日，陈仁洪服从组织决定，愉快地退居二线，不再担任济南军区政治委员职务。从北京返回济南后，陈仁洪与饶守坤抓紧军委扩大会议精神的学习贯彻，组织军区老班子10名常委和1名顾问召开最后一次民主生活会。会上，陈仁洪首先发言，他说：原来我对我们老班子全部退下来也没有思想准备，军委领导谈话后，我认识到，从长远看，从全局看，这样做对军队建设是有利的。他表示决心做到三点：一是抓紧遗留问题的处理，尽量不留或少留下疑难问题；二是认真负责地交好班，帮助新班子尽快熟悉情况，展开工作；三是对新班子的工作，只能支持，不能干扰。6月17日，军区在“八一”礼堂召开大会，热烈欢迎军区新的领导班子到职。陈仁洪主持大会，饶守坤讲话。陈仁洪看着比原领导班子平均年轻11岁的军区新领导集体，心里感到十分欣慰。
退居二线后，陈仁洪仍然以饱满的革命热情，关心党、国家和军队建设，积极支持军区新领导班子的工作。他认真回顾了自己走过的战斗历程，决心拿起笔，撰写革命斗争回忆录，为党史、军史提供历史资料。他不顾年迈体弱，重访当年战场，对时间、地名及人名等进行反复调查。有时为了查找一个地名，或回忆当时的作战经过，他在家中地板上铺开地图，趴在上面用放大镜仔细搜寻，一看就是1个多小时。对写成的回忆文章初稿，总是斟酌再三，反复核实。经过艰苦努力，陈仁洪先后写出近10篇回忆文章。
由于陈仁洪在战争年代的丰富斗争经历和较高的政治思想水平，应中央军委《中国人民解放军历史资料丛书》编审委员会之聘，他担任《南方三年游击战争》和《新四军》两部大型历史资料丛书编审委员会顾问，还担任皖南革命斗争史、江西地区革命史等资料征集研究委员会顾问，日程经常安排得满满的。用他自己的话说：晚年又开辟了一个新的战场。《南方三年游击战争》和《新四军》这两部大型历史资料丛书的初稿共约500万字，陈仁洪以对历史高度负责的精神，逐字逐句地审阅。有时为了核实某个历史事实或有关情节，他找来大量材料进行考证，还打电话找熟悉当时情况的老战友磋商。对把握不准的疑点，用红笔注上标记，夹上纸条，然后写出自己的看法和建议。在集体审核历史资料时，有时会不可避免地遇到一些棘手问题。为保证史料的准确性，同时也为避免一些不必要的争议，陈仁洪建议在坚持大的原则的前提下，个别问题采取宜粗不宜细、求同存异的方法，予以妥善解决以保证编审工作的顺利进行。他这种认真负责的精神，受到大家的尊敬和赞扬。他还为《南方三年游击战争》（闽北游击区）这本书，提供了《游击战争初期的闽北》和《艰难的岁月》两篇回忆文章。这两部大型历史资料丛书，凝聚着陈仁洪辛勤的劳动和心血。
陈仁洪每年收到很多从各地发来的请柬，邀请他参加党史、军史审稿会和研讨会，他每次都是认真准备，提出诚恳和有价值的建议。有一年，他曾4次南下，行程上万公里，先后到合肥、南京、崇安、福州等地参加会议。他还与9个地市和许多县的党史部门保持书信往来，提供史料和调查线索，帮助解决疑难问题，使党史部门的工作人员深受感动。
陈仁洪性格直率，也很重感情，家乡来人，他从不让住宾馆，不占用公款招待，而是让其住在自己的家里，他和妻子杨禵亲自下厨，使家乡来人感到既亲切又温暖。
1989年6月，经中央军委批准，陈仁洪离开济南进北京安置。10月，在解放军总医院查出白血病。面对绝症，陈仁洪心地坦然，保持着革命战争年代那种革命精神和乐观主义情怀。他积极配合治疗，并安慰家人和前来探望的老领导、老战友和老部下。1990年2月28日，陈仁洪被病魔夺去了生命，享年73岁。
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