吕祖志向高尚，不做朝廷官吏，超然于世俗之外，所以天下的人都不能与他为伴，王侯将相也不能做他的朋友。自从钟离祖师离开后，他就密秘地隐居在华山羽谷四十多年，到了唐朝末年，人们才知道他，这时他指点过李奇，李奇活到一百五十岁时才死。
吕祖度化了一百多人成仙，他时隐时显，姓名常常更改不一。五代时，他又隐居华山，自号无家宫。有时穿着麻衣布袍，人们叫他“麻衣道者”，他以《周易参同契》点化过陈抟先生。
陈抟和燕国丞相刘玄英（即刘海蟾）都曾拜吕祖为师父。刘海蟾祖师先遇到钟离祖师，钟离祖师用危如累卵来点化他，使他省悟入道，后来海蟾祖师也隐居华山修道。再后来，吕祖著《心易》一书，传授给陈抟，就是今天传播于世的《麻衣心易》。
吕祖还作《仙统秘诀》三篇，传授给刘海蟾祖师，今天道门中达道的大师大德们对于此书内容是心心相印而密秘传授，此书内容现存于《金莲宝箓》之中。
宋朝初年，吕祖离开华山，临行，赠诗给陈抟先生说：
青霄一路少人行，休叹兴亡事不成。
金榜虽云无姓字，玉京却幸有仙名。
云归大海龙千岁，雪满长空鹤一声。
后感宋朝明圣主，屡颁丹诏起先生。
后来，宋太祖和宋太宗果然三次下诏书来召请陈抟
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