清代总督和巡抚关系存在着三种类型：一种是总督兼巡抚，这实际上是只设总督，不设巡抚，这种情况地方官自然要听总督的；第二种是只有巡抚没有总督，这种情况地方官自然要听巡抚的；第三种是总督和巡抚分开，清代大致二省设一总督，每省设一巡抚，这一种情况又分为督抚同城，和督抚不同城两种情况，这种情况，牵扯到督抚分权、分治，所以地方官听谁的，要看具体事权来定。
下面就详细说说清代督抚制度：
清代在地方设总督和巡抚二官，为其疆臣。但是，督抚系常设之官，“专制地方”，而以布政、按察二司为之属，也就是所谓“总督、巡抚分其治于布政司，于按察司”，二者不仅是地方行政的最高长官，也是地方行政的最高层级。
督抚之官，肇置于明代。明初，命京官巡抚地方，有军事则命总督军务，因事而设，事已旋罢，原非一定官称。其后各省俱有之，且因事增置，遂为定员。
因此，明代自中叶以后地方行政体制实际上已经发生了变化。清代继续在地方设置督、抚之官，而其成为地方行政的最高层级，也有一个过程。
督抚之制定型的过程
1、华北地区
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