化学肥料是指用化学方法制造或者开采矿石，经过加工制成的肥料，也称无机肥料，包括氮肥、磷肥、钾肥、微肥、复合肥料等，它们具有以下一些共同的特点:成分单纯，养分含量高;肥效快，肥劲猛;某些肥料有酸碱反应;一般不含有机质，无改土培肥的作用。化学肥料种类较多，性质和施用方法差异较大。
我国化肥的利用率不高，当季氮肥利用率仅为35%，磷肥的利用率仅为10%~25%。磷肥利用率偏低不仅造成严重的资源浪费，还会使大量的磷素积累在土壤中，从而导致农田及环境污染。据联合国粮食及农业组织的资料显示，1980年至2002年中国的化肥用量增长了61%，而粮食产量只增加了31%。肥料利用率偏低一直是中国农业施肥中存在的问题。
化肥的危害之一是土壤里重金属和有毒元素有所增加，直接危害人体健康，产生污染的重金属主要有Zn、Cu、Co和Cr。从化肥的原料开采到加工生产，总是给化肥带进一些重金属元素或有毒物质。
危害之二是土壤里微生物活性降低，物质难以转化及降解。我国施用的化肥中以氮肥为主，而磷肥、钾肥和有机肥的施用量低，这会降低土壤微生物的数量和活性。
危害之三是加速土壤酸化。一方面与氮肥在土壤中的硝化作用产生硝酸盐的过程相关。首先是铵转变成亚硝酸盐，然后亚硝酸盐再转变成硝酸盐，形成H+，导致土壤酸化。另一方面，一些生理酸性肥料，比如磷酸钙、硫酸铵、氯化铵在植物吸收肥料中的养分离子后，土壤中H+增多，许多耕地土壤的酸化和生理性肥料长期施用有关。
化肥最严重的危害是使农作物养分失调，硝酸盐累积。我国施用的化肥以氮肥为主，长期施用造成土壤营养失调，导致NO3-N累积。NO3-N本身无毒，但若未被作物充分同化可使其含量迅速增加，摄入人体后被微生物还原为NO2-，使血液的载氧能力下降，诱发高铁血红蛋白血症，严重时可使人窒息死亡。同时，NO3-N还可以在体内转变成强致癌物质亚硝胺，诱发各种消化系统癌变，危害人体健康。
长期施用化肥的蔬菜，特别是氮肥过量所生产的“氮肥蔬菜”，其茎叶等可食部分，均被硝酸盐严重污染，会使蔬菜中的硝酸盐含量成倍增加，硝酸盐在人体中容易被还原为亚硝酸盐，亚硝酸盐是-种剧毒物质，它能引起人体细胞缺氧。如果ㄦ童长期食用这种蔬菜，会造成智カ下降，并能诱发癌症，危害极大。因此，在-些发达国家现已明文规定，氮肥蔬菜禁止上巿，以切实保证消费者的利益。
全靠化肥生产出来的鲜嫩蔬菜，看起来茎嫩叶肥，不知情者以为质量上乘，其实这种蔬菜硝酸盐含量超标，并且在堆放储存过程中也容易发霉变质，使有毒物质的含量增加。据测定，在冬春贮藏过程中，施用过氮肥的白菜比施农家肥的白菜腐烂损坏率高20%以上，其中硝酸盐含量也会成倍增加。
蔬菜土壤长期施用硫酸铵、硫酸钾以及含氮的化肥，会破坏土壤结构，使土壤板结，失去柔性和弹性，降低通水透气性能。长期施用化肥，土壤胶体上的钙离子不断被交换出来，在雨水和灌溉水的淋洗下，硫酸铵、氯化钙被淋洗到土壤下层，造成耕作层缺钙，破坏土壤结构，使土壤变得板结，肥カ下降，蔬菜长势差，降低产量。因为良好的土壤结构，除含有大量有机质外，-般都富含钙元素，缺钙的土壤结构再好，也是不固定的，易遭到破坏，只有含有-定钙质的土壤，其钙质水稳性团粒结构，オ是最理想的土壤，能生产出高产质优的蔬菜。
经常施用化肥会造成土壤的酸化危害，硫酸铵、氯化铵、氯化钾、过磷酸钙等酸性化肥在连年大量施用蔬菜地后，会使土壤中残留大量的酸类物质，使中性土壤变酸，酸性土壤更加酸化，既破坏了土壤微生物区系，ㄡ不利于大多数蔬菜的正常生长。长期施用化肥，尤其是连年多次施用硫酸铵、硫酸钾、氯化钾等，只能增加土壤中的硫酸根离子和氯离子的含量，而这两种离子对土壤来说都是有害的离子，不但有害于蔬菜生长，还会使土壤产生次生盐渍化，破坏土壤的结构，影响蔬菜对其他营养元素的吸收。蔬菜地长期过量施用化肥，不仅会对蔬菜造成危害，还会妨碍蔬菜对其他营养元素的吸收，引起缺素症。例如，过量施用含氮化肥会引起蔬菜的缺钙症。硝态氮过多会引起缺钼。钾过多会降低钙、镁、硼的有效性。磷过多会降低钙、锌、硼的有效性等。
因此，蔬菜地应最大限度地施用有机肥或其他非化学氮肥，替代化学氮肥，在不影响蔬菜正常生长发育的前提下，尽量以无抗生素污染的圈肥、鸡粪等有机肥和各种饼肥，代替化学氮肥，以防止蔬菜污染，减少化学肥料的残留和对土壤造成的污染和破坏作用。
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