在教育部的第四轮学科评估中，中国科学院大学作为一个科研单位整体参与评估，由于学科门类齐全，众多研究所实力不凡，评估结果出众，与当时双一流学科的入选情况大相径庭。
中国科学院大学由京内4个校区、京外5个教育基地和分布全国的114个研究所组成，有53个一级学科硕士点，39个一级学科博士点，169个博士后流动站。根据中科院官网2016年1月信息，中国科学院大学拥有国家实验室5个、国家重点实验室85个、中国科学院重点实验室211个、国家工程研究中心（实验室）41个。一个标准的研究所联合巨无霸。虽然在双一流学科评选中，中国科学院大学只入选两个双一流学科，分别是化学和材料科学工程，也没有进入国家双一流大学建设名单，但是并不影响其在教育部学科评估中的优异表现。
具体评估结果如下：
可以看出，中国科学院大学理学学科评估结果表现惊艳，绝大部分A+，傲视群雄。工学学科也表现优异，除此之外，还涉及到农学、医学、管理学等，均有上榜。
不过个人以为，把国科大放在科研机构中评比还是有道理的，毕竟其是整合了一大批研究所的结果，看其学科实力还是应该从单个研究所看起，其他研究所实力再强，互相影响也不大。如果学科实力可以简单相加，把国家所有研究所加起来不就成了一所世界超一流大学了吗，显然可行性为零。因此国科大的单个研究所实力并不能同它整体学科实力挂钩。
