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Nature Genetics | 豌豆基因组被破解,为豆科植物基因组进化提供了新见解
孟德尔 (Gregor Mendel)是遗传学的奠基人,被誉为现代遗传学之父。他发现了遗传学三大基本规律中的两个,分离规律及自由组合规律,统称为孟德尔遗传规律。孟德尔当年是通过豌豆实验揭示了这些遗传学规律,他进行了长达8年的豌豆实验,通过对不同代的豌豆的性状和数目进行细致入微的观察和分析,最终揭示了生物遗传奥秘的基本规律。据说,孟德尔经常对客人指着豌豆十分自豪地说:“这些都是我的儿女!。如果没有豌豆,这些遗传规律或许还要晚多少年才能面世。然而,贡献如此之大的豌豆,其基因组却一直未能被破解。
一个重要的原因是豌豆基因组非常大 (~ 4.45 Gb)。但近年来,随着相关技术的发展,大型基因组的测序和组装已成为可能。2019年9月2日,Université Bourgogne Franche-Comté的Judith Burstin领衔的多国合作团队在Nature Genetics在线发表了题为A reference genome for pea provides insight into legume genome evolution 的研究论文。该研究完成了豌豆(Pisum sativum L., 2n = 14) 的首个参考基因组,为豆科植物的基因组进化提供了新见解。


豌豆是重要的豆科植物,也是一种重要的蔬菜作物。这项最新的研究以豌豆品种‘Caméor’为材料,首次完成了豌豆的基因组草图。通过对不同豆科植物进行系统遗传学和古基因组学分析,发现了豆科植物的基因组重排,并揭示了重复序列在豌豆基因组进化中的重要作用。与其他已测序的豆科基因组相比,豌豆基因组具有强烈的动态化,可能与从其它豆科分化时的基因组扩张有关。在豌豆进化过程中,易位和转座在不同的谱系间发生差异。
Circos view of the pea genome. 

总的来说,豌豆的参考基因组序列为豆科植物基因组进化提供了新的见解。该参考序列也将加深对豆科作物重要农艺性状的分子基础的理解,研究结果对相关作物的遗传改良也具有重要的参考意义。

论文链接:
www.nature.com/articles/s41588-019-0480-1
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