园艺植物基因组：过去，现在，未来

自从第一个植物基因组即拟南芥基因组在2000年破译，植物基因组学的快速发展迄今已经有20年整。近日，南京农业大学陈飞博士和福建农林大学张亮生教授在Horticulture Research 上联合发表了题为Genome sequences of horticultural plants: past,present,and future 的综述文章。文章整体描述了园艺作物破译基因组的过去、现在和未来。该文章清晰梳理了已经破译的园艺植物基因组和相关的基因组数据库，列出了重要的未基因组测序的重要园艺植物，提出了园艺植物基因组计划，推荐了高杂合度、高倍性作物基因组测序策略，为未来园艺植物基因组破译提供了重要参考。

园艺作物包括了果树、蔬菜、观赏作物、饮料作物以及药用作物等，不仅为人类提供了大量的食物，还深刻影响着人们的艺术、文化和环境，从而影响了人类自身的演化。不同于模式植物，园艺植物的基因组高度多样且复杂，由于其悠久的进化和驯化历史，通常具有较高的杂合率和较高的倍性。随着测序技术在葡萄上的首次应用，在过去10年中破译的园艺植物基因组数量急剧增加。

图：已基因组破译的园艺植物的统计分析

作者总结了园艺植物的基因组测序，泛基因组的构建以及园艺基因组数据库的开发，讨论了与基因组测序、数据存储、数据质量、数据共享和数据可视化有关的过去、现在和将来的研究，从而为园艺植物的基因组研究提供了实用的指导，提出了园艺植物基因组计划，以及该计划的三个目标的路线图。

图：园艺植物基因组计划和高杂合度、高倍性园艺植物的破译思路

该文转自园艺研究（hortres）。论文原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41438-019-0195-6