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【PPT】深度学习技术在医学影像CAD中的应用

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2016年12月29日,由数翼、华院数据、数据六合实验室联合主办,COWORK协办的聚焦“人工智能医学影像识别的临床应用”的主题沙龙活动圆满结束。会上四位演讲嘉宾就围绕活动主题从不同角度进行了精彩的演讲,活动吸引了来自仁济医院、飞利浦、复旦大学、数据宝、格域数据等产学研多个机构的观众,现场大家积极提问交流、讨论热烈。下面是小编为大家呈上的演讲嘉宾干货内容,供大家交流学习。


活动现场


嘉宾简介


杨晶晶,华院数据技术(上海)有限公司大数据架构师。华院数据技术(上海)有限公司是中国最早从事大数据分析挖掘的企业。目前,公司以智能引擎和数据互联为核心,致力于成为中国大数据应用裂变加速器,并已成功孵化分析、数云、数创、数尊等近二十家各垂直领域的大数据应用公司。


活动演讲嘉宾  杨晶晶


演讲主题:

Deep Learning for Medical Image CAD


各位嘉宾大家下午好,接下来由我为大家带来分享。刚才三位嘉宾从医学影像未来发展、能带来何种价值以及现有的商业模式角度作了分享,那么我就承上启下,把到底该如何做,在国外取得什么样的效果,给大家更加直观的解读。我们是来自华院数据的研究团队,我们华院是从2002年成立,是中国最早从事大数据分析挖掘的企业,拥有十几年的数据挖掘和机器学习技术积累,在电商、电信、医疗、汽车等众多领域有丰富成果。我们团队近期更多关注人工智能、机器学习,尤其是医学领域的一些方向,这些研究成果将会推动华院在相关领域的孵化。


我今天的演讲主题是深度学习技术在医学影像CAD(Computer Aided Detection and Diagnosis)中的应用,主要从三个角度来分享,首先从直观角度讲述一下深度学习,然后欧洲两个乳腺方面的例子帮助大家从detail的层面理解深度学习在图像里面能起到什么作用、还有哪些优缺点,最后是我们研究的心得与大家分享一下。


Introduction to Deep Learning


深度学习,它的“深度”体现在它是基于传统的神经网络基础,作了一些深度的延展。下图是深度神经网络,神经网络是受人类大脑神经结构的启发,分为很多层,每一层都有许多神经元,神经元将对数据特征进行学习。


这种技术有别于传统计算机技术的特点是什么呢?比如,我们要做一个自动驾驶的汽车,汽车前后左右加速减速转向等,我们不可能用人的规则编程,我们没法预知它的环境,所以没法用传统编程技术做自动驾驶汽车,因为在不同环境需要的决策是无法通过人类大脑预知的。但是深度学习技术在这方面取得了非常大的效果,自动驾驶技术指日可待,在美国很多内测已经取得很好的效果,像谷歌、特斯拉。



稍微讲下卷积神经网络在图像识别一些经典的应用。这是一个图片分类的应用,包括现实中的任何物体,都可以识别出来。刚才陶总也讲到,任何识别都是有一定概率的,是有一定置信度的。除此之外,还可以做物体定位,比如图片中人骑自行车,通过CNN可以把图片中各种物体区域标记出来。另外,还可以做像素点分割,分辨出像素点属于哪种类别,比如红色区域是马、粉红色区域是人、黑色是背景;这个可以应用在安防领域。






深度学习之所以那么火,还是因为它巨大的作用。人工智能是很早的技术了,之前技术成熟度不够;现在得益于深度学习技术发展,表中看出2010年到2015年ImageNet的图片识别错误率大幅下降,并且超越了人类的水平。



最近几年深度学习在世界尤其是欧洲在医学影像的应用有哪些方面?如乳腺癌的筛查、病罩定位与分类;肺癌的筛查和初步诊断;肝部肿瘤区域识别;脑瘤位置定位;黑色素筛选识别等。



Cases Study

现在我们结合几个例子,看怎么样运用技术实现应用。


Case1:Mitosis Detection in Breast Cancer Histology Imageswith Deep Neural Networks


病理医生水平要求比较高,且在美国比较稀缺,是比较昂贵的,中国病理医生也有较大的缺口。这个研究是利用CNN技术在公开的数据库进行,这是比较早的一个研究,且利用的是2012年欧洲的数据库,提供了很多病理切片,结果发布出来后,第三方还可以对数据进行验证;这种利用CNN技术进行辅助诊断,是超越了所有传统模式。



这是用染色做的切片,绿色圆圈即是有丝分裂的细胞,框出来的需要重点排查;蓝色是正常细胞,红色是假阳性。可以看到,普通人眼是几乎无法区分这些细胞,而且很难统计图里有多少这样的细胞。



这是2012年欧洲的数据集。它由五十张图片组成,通过高倍显微镜5个不同的活性切片来获得。把它数字化图像之后,每个恶性有丝分裂的位点,都是专业病理学家人工标注的,然后分成3个数据集。先把恶性细胞标注出来,通过切片技术分割成小的图片,分成了6.6万张,同时也切了6.6万张良性细胞的图片。










第一个案例带给我们的线索:第一深度神经网络在癌症的早期筛查上毋庸置疑效果非常明显;第二在病理这样的难题上表现优秀,潜力巨大。  


Case2:Large scale deep learning for computer aided detection of mammographic lesions


把时间轴平移到2016年,这个案例是做乳腺早期恶性病罩的筛查,此次运用的技术比2014年先进,数据量也比2014年要大。













Conclusion


下面是我们研究的一些心得与结论:




华院数据创始人、CEO宣晓华博士与大家交流

转自:华院数据

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