病理学科虽然被认为是「医学之本」，与检验、影像并称为推动临床医学发展的三大支柱学科，但在我国，病理学科发展面临很多痛点和难点。病理学科如果要列举病理学科发展面临的短板，业界大多信手拈来：受重视程度不够、人才短缺、学科定位偏差、资源配置不科学、话语权较弱、硬件投入太少......
2019年，中华医学会病理学分会做了一个调查，结果显示：全国有17624名从业医生，13887名技术人员，有4957个病理科。根据2009年卫生部发布的《病理科建设与管理指南（试行）》，每100张病床应该配备1-2名病理医生，病理科技术人员和辅助人员按照与医师1:1的比例配备，以此计算，我们现在至少还缺5万名病理医生。人员匮乏也影响了临床与病理的互相促进，影响新技术的研究和应用，而这些，对医务工作者、病人以及学科发展而言，都是不利的。
在学科划归上，病理学与病理生理学归属于基础医学的二级学科，但是病理学主要关注形态学和发病机制，而病理生理学主要关注功能性变化，两个学科归到一起是不合理的；病理学还包含了临床病理科的工作，因此临床病理学应该作为独立的临床学科。
在学科划归上，病理学与病理生理学归属于基础医学的二级学科，但是病理学主要关注形态学和发病机制，而病理生理学主要关注功能性变化，两个学科归到一起是不合理的；病理学还包含了临床病理科的工作，因此临床病理学应该作为独立的临床学科。目前教育部把「病理学与病理生理学」放在一起并归为二级学科，是沿用了前苏联的模式，有一定的局限性。而且，「病理学」与「病理生理学」专业含义并不相同，病理学是从形态学角度研究疾病并为其提供组织病理学依据；病理生理学是从机能和代谢角度揭示疾病发生发展的规律和机制。所以虽然划在一起，其实也是各研究各的。病理科长期被划归到辅诊科室，对病理学科的发展不利。
因为病理是临床诊断的金标准，病理医生需要有扎实的临床基础，所以比较理想的做法是利用住院医规培机制，病理医生需要的知识面很广，要求很多创新方法的应用。因此高质量的住院医规培就显得非常必要。目前部分医院的住院医生规培制度是流于形式的，如何保证规培医生的同质性，也是标准化培训的努力方向。
今年中国医师协会把病理学作为紧缺专业，在住院医规培上有一些政策的倾斜，吸引更多医生来从事病理的培训。病理医生的培育周期很长，这些政策的支持需要近10年时间才可能看出明显效果来。此外，病理医生的短缺，也可以用病理助理来弥补。病理学中的取材太重要了，后面的每一步都可以弥补，只有取材问题弥补不了。可是作为一个高年资医生，不可能盯着每一个送检病理样本取材，所以负责取材的病理医生助理非常有价值。
在我国的所有医院，病理科被划入医技（辅诊）科室。医技（辅诊）科室的概念也是前苏联的体系，本来临床和辅诊学科的划分只是功能的不同，但在我国的临床实践中却被人为分了高下，对学科发展显然不利。一个辅助科室怎么可能成为临床医学的支柱学科和「医学之本」？
客观而言，病理科在医院里处境的「尴尬」，部分源自其创收能力偏弱：多数综合性医院的年收入中，10%来自检验科，1%来自病理科。因为病理科创收能力不强，所以医院在病理科的设备仪器购买、办公条件改善等方面并不积极。同时，很多病理科医生也会选择转入收入比较好的临床科室。
不少医院的病理实验室设施还停留在10多年前，大部分医院的病理科比较陈旧，自动化程度低，设施严重滞后。没有长远规划，病理科留不住人。
如何提升病理科在医院的地位？专家们建议要改变病理科的科室设置，同时也要积极融入临床，在练好自身基本功的同时，引领临床发展。而在与临床的融合发展上，不少专家也建议，病理人不应仅仅强调病理是金标准，更应该放下身段，拥抱临床治疗需求，因为临床需求才是病理发展的目标。融入临床，病理才能发展好。
随着个性化治疗、靶向治疗、精准医疗的发展，病理与临床的关系越来越密切。不少专家表示，病理应该由此前的被动变为主动，从后台走向前台，引领临床医学的发展，只有摆正病理科的位置，为临床提供服务，让临床信任、依赖病理，病理的地位才能越来越高。
此外，病理的收费结构也需要调整，病理的收费标准中，其实没有凸显医生的专业知识价值。比如，在陕西省，一个胃镜的蜡块诊断140元，但这其中，病理医生的诊断所占的比重很低，主要还是蜡块和切片制备的费用。我们需要解决收费结构的不合理，更体现知识的价格。
资源配置不平衡
资源分布不平衡，也是造成病理人员短缺的因素之一，资源分散的现状不仅不能保证医疗质量，对一个医院单枪匹马的病理医师而言也是压力巨大，也极不利于病理医师的培养和成长。如果在这这些地区进行资源整合，建立区域性病理诊断中心，就可以形成合力，其人员规模就相当于一个三级医院的病理科，对提高病理诊断能力和水平、更好地为临床和患者服务，无疑会产生质的变化。由于各种各样的原因，要做到这一点其实很难。
全国70%的县级医院、二级医院只有1-2个病理医生，其中50%只有一个病理医生，病理服务能力比较差，也没有实力积极开展新技术。而且，也满足不了规范的要求。病理报告要双签字，一个主诊一个复诊，做冰冻还需要副高资格的医生。此外，这种状况对于病理医生的成长和发展，也是不利。
一些医院设立病理科是为了等级评审。但是小医院本身病理需求也少，而且病种单一，有的医院一年平均下来也就做2000例病理，医生的经验根本积累不起来。成立病理科需要有最低标准，包括场地(需有取材、冰冻、常规制片、常规染色、特染、免疫组化、细胞和原位杂交等实验室，以及办公学习场地)、人员(3名以上医生和多名技术人员)、基本的设备和试剂等，才能保证发病理报告的基本条件。十年前陈杰就提出建议，县域可以设立一个区域病理中心，但显然，这一建议并未切实落地。一个县级区域设立区域病理中心，还设想可以通过三甲医院的病理科资源下沉，帮扶基层，实现同质化管理。
作为现代临床医学的基础，病理诊断的质量也决定着临床医疗的质量。病理诊断的质量由几方面构成：一是送检的标本能否正确取材，假如没取到病变部位，就会造成漏检；二是疾病的病变，需要一定的技术质量以保证诊断的准确性和正确性；三是病理诊断的标准化水平，需要通过提高实验室规范化，确保不同医院的取材、制片都达到一定水准，从而做出准确的诊断。也就是说，从标本取材、标本固定、制片质量，到常规切片检测、免疫组化检测以及分子检测，都需要不断地规范，提高质量，才能满足诊断的需要。
有的基层医院一年做了几千例手术，却做不了多少病理诊断，人体切下来的样本都扔了。怎么能随便就扔了？但却是在基层医院司空见惯的。病理质控的目的就是达到质量的均质化。但是，由于中国城乡差别、东西差别比较大，所以质控开展的比较晚，情况也比国外要复杂的多。
目前，各家医院的病理报告是不互认的，原因之一，诊断是医生的主观判断，所以不能互认。但是，本来可以互认的病理结果，因为质量差异很大，所以转诊医院也不会认可转出医院的结果，必须再在转诊的医院重新诊断，有时还需要重新做检测。一旦实现同质化管理，也意味着病人在转诊过程中，就不需要重复进行部分病理检测。
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