许多人都经历过大肠杆菌感染，这种感染通常只是带来腹泻等不算严重的后果。然而，对于一些有基础疾病的患者来说，例如白血病患者，大肠杆菌有进入血液的风险。在这种情况下，大肠杆菌感染往往是致命的，死亡率高达15-20%。
治疗这类细菌感染的主要方法是使用抗生素，而这会对我们的肠道微生物群带来不利影响，还会产生其他副作用。此外，抗生素耐药性问题日益严重，这也使得抗生素在治疗细菌感染方面的效果有所下降。
近日，丹麦科技大学、基因编辑疗法公司SNIPR Biome的研究人员在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为：Engineered phage with antibacterial CRISPR–Cas selectively reduce E. coli burden in mice 的研究论文。
该研究开发了第一种基于CRISPR的口服候选药物，该药物能够选择性靶向并清除大肠杆菌，而不影响其他肠道微生物群。目前该药物已在进行1期临床试验，旨在减少和预防血液类癌症患者肠道中大肠杆菌易位到血液而导致的致命感染。
论文通讯作者、丹麦科技大学教授、SNIPR Biome公司联合创始人 Morten Otto Alexander Sommer 表示，这种基于CRISPR的窄谱药物可能对癌症患者非常有用，尤其是那些经常受到严重感染的癌症患者，这些感染很难用目前的抗生素治疗。
抗生素治疗对人体肠道微生物群有不利影响，还会导致抗生素耐药性。在这项最新研究中，研究团队筛选了162个天然噬菌体，他们发现，其中8种噬菌体在靶向大肠杆菌方面表现突出。然后，他们通过CRISPR基因编辑对这些噬菌体进行改造，进而设计出了4种CRISPR-Cas武装的噬菌体，它们具有更强的靶向并清除大肠杆菌的能力。
研究团队将这4种噬菌体的混合物命名为SNIPR001，能够特异性靶向和高效清除肠道微生物群中的大肠杆菌。
该研究显示，在小鼠和猪的肠道中，这种基因工程噬菌体混合物耐受性良好，还能有效减少大肠杆菌的出现。
而在2022年4月，SNIPR Biome公司宣布启动了口服CRISPR药物SNIPR001的1期临床试验，目前该药物已被美国食品和药品监督管理局（FDA）授予快速通道认定。
SNIPR Biome公司 CEO Christian Grøndahl 博士表示，这种基于CRISPR的创新疗法有望彻底改变我们预防和治疗细菌感染的方式，相信它还能成为开发针对其他危及生命的病原体的类似疗法的典范。通过整合药物开发的不同方面，从生物信息学到监管要求，我们已经能够利用CRISPR-Cas技术来开发一类全新的药物。
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