幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，Hp）是1982年由Warren JR和Barry Marshall教授发现的。他们经过37次培养实验，成功从人类胃黏膜培养出并自己吞服培养菌进行人体实验，证实幽门螺杆菌可诱发急性胃炎，服用抗生素可治愈，2005年他们共同获得了诺贝尔医学和生理学奖。流行病学统计发现，世界上50% 的人群携带有幽门螺杆菌，有些地区甚至有80%的人携带这种细菌。然而在这些携带者中，只有10%患上了消化性溃疡，只有1%左右的人会患上胃癌。在印度、泰国、孟加拉国、巴基斯坦这些国家，幽门螺杆菌的携带率非常高，但这些国家人的胃癌发病率却很低。微生物学专家马汀·布莱泽教授曾提出：“那些寻求幽门螺杆菌和疾病间简单关系的人无疑会失望；这其间的错综关系可能始于人类诞生之前。”
近年来，越来越多的研究显示了幽门螺杆菌对人体可能存在的保护作用，并且一些研究也反映了根除后会出现的问题。首先在发展中国家，携带幽门螺杆菌的儿童更不容易患上过敏，且可以降低哮喘的发病风险，在年龄分层的统计分析结果中，比中位数年龄小者（即3 岁～13岁亚组），幽门螺杆菌阳性率和哮喘、曾患哮喘或过敏性鼻炎之间存在最为明显的负相关性，通过基础实验发现幽门螺杆菌抑制哮喘的发生与发展的作用在CagA+型幽门螺杆菌中表现更明显。研究还发现，携带幽门螺杆菌可以降低湿疹、皮炎的发生率。马汀·布莱泽教授认为幽门螺杆菌可以调节胃酸水平，创造既适合它生存也适合宿主（人体）的环境。
调查发现美国和其他发达国家在20世纪以前，随着胃幽门螺杆菌的根除，胃癌相对发病率呈曲线下降，然而当幽门螺杆菌被根除及胃癌发病率下降同时，食管腺癌的发病率在几十年后开始上升，考虑幽门螺杆菌的过度根除可能与之相关。其中，研究显示CagA+型幽门螺杆菌株对试管腺癌具有保护作用。其次，幽门螺杆菌可能预防炎症性肠病的发生， 主要机制可能是通过免疫调节进行的。在随机临床试验中，进行了幽门螺杆菌根除的人BMI有显著增加，考虑可能是和治疗了消化不良后进食增加有关。研究发现，在发达国家中幽门螺杆菌的携带比例越低，肥胖率就越高。从这些研究中可以看出，并不是所有的幽门螺杆菌都需要绝对消除，如果换个角度，将幽门螺杆菌视为一种共生菌，去寻找它与健康人群间的共生关系，会获得不一样的认识。
因此，从这个角度来看，或许能将幽门螺杆菌的治疗从消灭转为预防——即维护正常的消化道菌群、找出低致病性甚至无致病性的幽门螺杆菌菌株作为疫苗、保持健康的饮食和生活方式以防止胃黏膜受损，也许才是更理想的治疗方式。
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