SILAC（定量蛋白质组学)技术原理

作为蛋白质组学研究中一种强有力的工具，质谱在过去很长一段时间内只是用于定性研究，鉴定蛋白质和**后修饰。于是，科学家们不断开发出定量蛋白质组学方法，来了解细胞、组织或生物体的整体蛋白质动力学。

早期的蛋白质研究致力于鉴定并了解单个蛋白或蛋白复合物的功能，这些年，仪器和技术的进步大大促进了蛋白质组学研究。这种蛋白质组学的研究，与当今热门的基因组、转录组和代谢组等领域的研究一起，让我们更好地了解了整体的生物过程，以及它们如何应对不同刺激，或在**状态下如何改变。若想了解一个人患病之后，基因表达水平发生了怎样的改变，DNA芯片是一个常见的选择。然而DNA芯片也许并没有说出全部，因为基因表达的差异并不直接对应着蛋白表达的差异。为了更准确地比较两个样本的蛋白水平，科学家们通常使用双向电泳外加质谱，然而流程复杂，通量低，重复性也欠佳。为什么不能定量?因为各次运行之间，水解后的肽段在理化性质上表现出很大差异，从而导致质谱响应的变化。此外，质谱只能对样品中的一部分肽段进行分析。

定量蛋白质组学又分为相对定量和定量。相对定量方法(如SILAC、ICAT、ICPL等)是用来比较样品之间的蛋白或肽段丰度；而在未标记的样品中加标有已知浓度的同位素标记的合成肽段，就实现了目标肽段的定量。显然，定量比相对定量更为理想，因为不同样品的肽段值也可用于比较相对蛋白变化。然而，相对定量却更为常用，因为每个目的蛋白的定量都需要昂贵的试剂，也需要花费大量的时间来开发分析。在相对定量方法中，SILAC又是比较常用的一种。