蛋白质组(Proteome)的概念先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随著组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,并且,同一蛋白可能以许多形式进行**后的修饰. 故一个蛋白质组不是一个基因组的直接產物,蛋白质组中蛋白质的数目有时可以超过基因组的数目. 蛋白质组学(Proteomics)处於早期“发育”状态,这个领域的专家否认它是单纯的方法学,就像基因组学一样,不是一个封闭的、概念化的稳定的知识体系,而是一个领域. 蛋白质组学集中於动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定**、**对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制. 作為一门科学,蛋白质组研究并非从零开始,它是已有20多年歷史的蛋白质(多肽)谱和基因產物图谱技术的一种延伸. 多肽图谱依靠双向电泳(Two-dimensional gel electrophoresis, 2-DE)和进一步的图象分析;而基因產物图谱依靠多种分离后的分析,如质谱技术、氨基酸组分分析等.
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