虽然CBE和ABE能实现C到T和A到G的转换，但是其他不同碱基之间的转换仍然受限，于是研究者继续开发出能适应所有碱基转换的技术——先导编辑器（Prime Editor，PE）。PE除了能实现碱基的替换，还能有效实现多碱基的精准插入和删除[7]。PE也是以CRISPR/Cas9系统为基础，由改造的sgRNA（pegRNA）和融合蛋白组成。pegRNA是在原先sgRNA的基础上添加能互补断裂的靶DNA链3’末端的序列（PSB）和带有突变位点或插入缺失的目的序列（RT模板）。而融合蛋白是nCas9（H840A）与逆转录酶融合而成。PE的工作原理是pegRNA引导融合蛋白到达靶序列区，然后nCas9断裂被编辑的DNA，接着PSB结合上断裂的靶DNA，在逆转录酶和RT模板下逆转录出含有突变位点的目的序列。反应结束后会形成带有目标突变的3’flap结构的DNA链和无任何突变的5’flap结构的DNA链。细胞内5’flap结构易被结构特异性内切酶识别并切除，之后经DNA连接和修复便实现了精准的基因编辑（图4）。
图. PE的工作原理[8]
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