由于实验室质粒的人造特性，它们也被称为“vectors”（载体）或“constructs”。为了将基因插入到载体中，科学家可以利用许多可选择的克隆方法（酶切连接法、Gateway、Golden Gate，Gibson等等）。克隆方法的选择取决于所用的质粒骨架，一旦克隆步骤完成，包含新插入基因的载体将被转化到细菌细胞中并且将转化菌液涂在含有抗生素的板子上进行选择。质粒构建简化过程：提取质粒，扩增目的基因片段——对质粒和目的片段进行酶切处理——连接——转化——培养——鉴定
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