【文献速递】 “连锁”追踪揭示结直肠癌中T细胞动态关系

“连锁”追踪揭示结直肠癌中T细胞动态关系

Lineage tracking reveals dynamic relationships of T cells in colorectal cancer

Lei Zhang, Xin Yu, Liangtao Zheng, Yuanyuan Zhang, Yansen Li, Qiao Fang, Ranran Gao, Boxi Kang, Qiming Zhang, Julie Y. Huang, Hiroyasu Konno, Xinyi Guo, Yingjiang Ye, Songyuan Gao, Shan Wang, Xueda Hu, Xianwen Ren, Zhanlong Shen, Wenjun Ouyang & Zemin Zhang

 

一

摘要

T细胞是肿瘤免疫治疗的关键要素，但人们对T细胞的某些基本特性仍知之甚少，例如肿瘤内T细胞的发育和迁移。T细胞识别外源及自身抗原需要大量T细胞受体（TCR）库，而大量TCR又可作为追踪肿瘤中T细胞的标签。在本研究中，研究者从12例结直肠癌（CRC）患者中获得了11,138个单T细胞的转录组，并开发了STARTRAC（通过RNA-seq和TCR追踪进行单个T细胞分析）生物分析学方法，以定量分析20个具有不同功能及克隆特点的T细胞亚群之间的动态关系。尽管CD8 +效应细胞和耗竭T细胞都表现出高克隆扩增，但它们与肿瘤内的CD8+效应记忆T细胞独立相关，这提示TCR的“关键性决定作用”。在CD4+T细胞中，大多数肿瘤浸润性Treg细胞显示克隆排他性，而某些Treg细胞克隆在发育上与多个TH细胞克隆连锁。值得注意的是，我们在肿瘤中鉴定出两种IFNG+TH1样细胞，即GZMK+TEM和CXCL13+BHLHE40+TH1样细胞，它们分别与不同的IFN-γ调节转录因子EOMES/RUNX和BHLHE40相关。微卫星不稳定（MSI）结直肠肿瘤中，CXCL13+BHLHE40+TH1细胞富集，这可能是MSI患者免疫检查点阻断疗法临床反应更好的原因。此外，IGFLR1在CXCL13+BHLHE40+TH1样细胞和CD8+耗竭T细胞中高度表达并具有协同刺激功能。本研究中，STARTRAC分析为全面分析CRC中T细胞特性提供了有效方法，未来可用于分析其他肿瘤中T细胞的动态关系。

图1. STARTRAC定量分析T细胞分布特征、克隆增生、迁移及状态转换关系

图2. MSI患者显著富集高表达BHLHE40和IGFLR1的CXCL13+ TH1样细胞

翻译校译：王俊

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