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脑肿瘤分割技术---3DSlicer和ITK-SNAP分割教程

      脑肿瘤的分割是神经影像后处理领域的一个重要内容,与脑区域分割和心脏分割相比,脑肿瘤由于肿瘤的大小范围、囊实性、瘤周水肿、血供等因素,其分割任务也由于个体间形状、纹理等差异大,从而实现更加困难。

      医学上用于分割脑肿瘤的方法很多,比如基于阈值的分割方法、基于区域的分割方法、基于边界的分割方法、基于聚类的分割方法等等;应用的软件也很多,比如3DSlicer软件、ITK-SNAP软件、MRIcron软件、mimics软件等等,其中最主要、最常用的软件还是3DSlicer软件和ITK-SNAP软件这两种软件。

软件下载地址:Download 3D Slicer | 3D Slicer    ITK-SNAP Home (itksnap.org)

首先我们介绍一下3DSlicer软件和ITK-SNAP软件这两种软件在分割肿瘤的对比及选择。

如何用3D Slicer和ITK-SNAP分割大脑三维图像

以下视频部分来源于束旭俊老师哔哩哔哩(bilibili)网站上TecNerd公众号的视频教程。有兴趣的老师可以关注该公众号后进站学习交流。

TecNerd

(一)如何用ITK SNAP分割胶质瘤及瘤周水肿。

1、ITK SNAP教程之分割胶质瘤

2、ITK SNAP教程之肿瘤水肿带分割

当然ITK-SNAP除了肿瘤分割,也可以应用同样的方法进行感兴趣区域(ROI)的勾画及大脑分区的勾画等。

(二)如何用3DSlicer分割胶质瘤及瘤周水肿。

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