税务机关检查企业发票是否合规，有一套严密的程序，企业财务人员一般无从知晓，等稽查发现时只能交罚款了，这里有一套税务机关稽查发票的完整程序：

一、检查发票印制环节是否合法

1、出口发票的印制是否由税务机关批准印刷，并按顺序使用；

2、印制有本单位名称的发票是否有县（市）级以上税务机关批准，其中印有本单位名称的专用发票是否由国家税总局批准；

3、是否存在其他私自印制发票的行为。

二、检查发票领购环节是否合法

1、结合发票领购簿核准的种类、数量以及购票方式，审核发票领购情况；

2、结合有关货币资金、往来科目的审核，检查是否存在向他人提供发票或借用他人发票等未按规定领购发票的行为。

1、将销售发票与货币资金、应收帐款、收入等帐户进行核对，以确认已开具的发票是否已及时、全额入帐；

2、根据货币资金、往来帐户以及产成品出入库单等单证，审核销货退回、销项税额的帐务处理是否正确；

3、审核收款发票并结合有关往来科目，检查是否存在隐瞒收入、价外费用等偷税行为；

4、结合有关合同、货币资金、往来科目、生产工艺产品目录、原料出入库票产成品出入库单的审核，检查发票开具的真实性：是否存在虚开发票行为；是否开具票物不符发票；是否开具作废发票；以其他单据或白条代替发票；单联填开或上下联金额、增值税销项内容不一致；扩大专业发票或增值税专和发票开具范围；

5、结合销售方式，检查发票开具时间的准确性；

6、开具的发票票面合法性检查；是否按顺序填开；是否未经许可，拆本使用发票；填写项目是否齐全，内容是否真实，字迹是否清楚，税率是否准确；发票联和抵扣联是否加盖财务印章或者发票专用章；开具其他不符合税务机关规定的发票；是否开具扩大专业发票范围或增值税专用发票开具范围的发票。

1、结合有关合同、货币资金、原材料入库单等单证、往来科目的审核，检查取得发票的真实性：应取未取得发票；取得虚开发票；取作废发票；以其他单据或白条入帐；取得单开、上下金额不一致发票；取得票物不符发票；

2、对取得发票时间准确性的检查；

3、对取得发票票面合法性的检查；

4、对从境外取得的发票认为有疑义的，可要求其提供境外公证机关或注册会计师的确认证明。

五、检查发票保管环节是否合法

1、结合发票领购簿、发票存根联检查发票保管情况，是否存在未按规定保管发票的行为：

2、丢失发票；损毁发票丢失或擅自损毁发票；未按规定缴销发票合理性检查。

以上五种税务稽查发票程序，企业财务人员可对照检查自己处理是否合规，做到心中有数。

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