所谓“过滤”，就是过滤污垢，予以排除或再生。鱼池就是要不断加入良水，将带粪便的底水排掉，这样鱼池水就能维持干净状态。不过，要随时维持良质水并不是简单的工作，如果要照上述方法做，所须成本也很高。
因此，锦鲤饲育就采用循环过滤方式。“循环过滤方式”就是将水往上吸，让水通过过滤槽，予以处理、再生为饲育水，再灌回鱼池里。循环过滤方式大致可分为两个方法，就是“强制过滤法”与“生物过滤法”。这两个方法各有优缺点，在此针对其特色进行讨论。
“强制过滤法”就是安装“强制过滤”之类的机器，以物理方式将污物逆洗、排出，这样就能让池水中的污物（有机物）总量减少。强制过滤机可以将浮游物、垃圾等等的固体物全部清除，让水质非常干净这就是它最大的优点。
不过，强制过滤法只是滤取污物，予以舍弃，没有做清洗动作，没有被牵引在滤材上的物质又会再回到水池里。这类再回到水池里的物质包含阿摩尼亚、亚硝酸在内。
我们的爱鲤都会排尿、排粪便。粪便中所含的水溶性阿摩尼亚物质并不会被牵引至滤材。几乎都再回到水池里。
回到水池时，因为曝氧的关系，蒸发掉的阿摩尼亚量是很少。加上爱鲤经常会排泄，于是池水中的阿摩尼亚浓度就会上升。因此，强制过滤机只是拥有急速过滤功能，基本上只会排出污物，无法让水质再生。不过，有些机型还兼具了生物过滤功能。
接着，聊聊生物过滤法。“生物过滤法”是利用细菌类，也就是微生物的力量将混有阿摩尼亚物质的饲育水再生。
生物过滤法的细菌大致可以分为两大类。这两类就是好氧性细菌与厌氧性细菌。好氧性细菌是喜欢氧气的细菌，氧气越多，好气性细菌活力越强。厌氧性细菌是讨厌氧气的细菌，在无氧状态下它才会产生作用。虽然两者性质不同，但都是处理阿摩尼亚物质的细菌。
那么，饲养锦鲤的话，该选择那种细菌？答案是“好氧性细菌”。厌氧性细菌过滤处理时，会产生沼气。而且厌氧性细菌喜欢栖息于黑色污泥水沟。现在人很少有机会能看到黑污泥水沟，不过厌氧性细菌就喜欢这种环境。住在黑色污泥水沟的厌氧性细菌会进行水质处理工作。如果是40几岁的读者，在夏天时应该看到过会从底部冒泡的水沟吧？那个就是沼气，沼气对生物有害。
因此，好氧性细菌才适合锦鲤饲育的循环过滤作业。为了让好氧性细菌变多，能够更有效率地工作，需要氧气。没有氧气就会变成厌氧性细菌囤积，请多加注意！
让好氧性细菌增多的另一个重要因素为时间。所谓的“时间”是指流速、细菌与水的接触时间、欲处理的有机物或阿摩尼亚物质与细菌接触时间。在有细菌栖息的场所，如果水流过快，接触时间短，等于没有处理到。
细菌的饵料为阿摩尼亚物质或有机物，接触时间短。那么，怎样的流速最恰当呢？水经过过滤槽的时间恰好是20-30分钟以上。
现在就尝试计算过滤槽容量与帮辅性能。如果水通过过滤槽时间太短，可以制作导管，调整水量，让通过时间变慢，让污物沉淀，再以虹吸管原理将污物快速排除。好好运用强制过滤法与生物过滤法的优点，来净化饲育水吧。
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