编码RNA与非编码RNA（二）

snoRNA是核仁小RNA（small nucleolar RNA），长度约60-300 nt，位于核仁中，主要负责RNA的转录后修饰和成熟。

snoRNA分为两类，C/D box snoRNAs 和 H/ACA box snoRNAs。前者负责核糖2’-O-甲基化，后者负责假尿嘧啶化（pseudouridylation），即由尿嘧啶核苷(U)生成假尿嘧啶核苷(ψ)。

两类snoRNA的结构与功能，红线表示目标RNA。引自Front Oncol. 2019 Jul 9;9:587

最近的证据表明snoRNA在基因表达调控中也起着重要作用。它参与调节选择性剪接，还可以影响RNA编辑过程。有报道snoRNA参与应激反应，调控脂肪酸、胆固醇、葡萄糖代谢等过程。

这些代谢过程涉及到细胞的生长、分化等重要事件，所以snoRNA广泛参与许多生理和病理过程，也包括癌症。snoRNAs作为肿瘤生物标志物和治疗靶点已有许多研究，如SNORD114-10与卵巢癌转移，SNORA23与胰腺导管腺癌等（Front Oncol. 2019 Jul 9;9:587）。

TERC（telomerase RNA）是端粒酶的RNA部分。端粒酶是一种核糖核蛋白（RNP），通过逆转录作用解决线性DNA分子的末端复制问题。研究发现，端粒酶RNA不仅仅用作逆转录模板，它在整个端粒延长过程中起着重要作用。比如其结构中高度保守的假结（pseudoknot，PK）结构，在端粒酶催化期间表现出大规模的构象重排，显示其具有重要作用。

端粒酶RNA结构。引自Wiley Interdiscip Rev RNA. 2018 Mar;9(2)

端粒酶与衰老、肿瘤等过程密切相关，端粒酶RNA研究也具有重要应用价值。目前，降低重复添加进行性（RAP）的端粒酶抑制剂已在一些癌症类型中显示出治疗潜力（Wiley Interdiscip Rev RNA. 2018 Mar;9(2)）。

端粒酶作用机制，文献同上。

调节ncRNA通常短暂表达，并有明显的时空特异性，对转录、翻译等过程起调节作用。主要包括siRNA、miRNA、piRNA、lncRNA和circRNA等。

siRNA（small interfering RNA）是一类外源的双链小分子RNA，长度为21-25 bp。它通过RNA干扰途径降解目的mRNA，从而降低基因表达。现已成为实验室中研究基因功能的常规手段，一般称为knockdown（敲低）。

miRNA（micro RNA）是长约21-25 nt的单链RNA，也是通过RNA干扰途径降低基因表达，但它是内源性的，即自身基因表达产物。另外，siRNA需要与目的mRNA完全配对才能发挥作用，而miRNA允许错配。miRNA一般与靶基因3’UTR结合，而siRNA一般针对编码区。

micro RNA的产生与功能，引自百度图片

piRNA（Piwi-interacting RNA）是在哺乳动物生殖细胞中发现的单链RNA，长度约为24-31 nt，通过与PIWI蛋白家族成员相结合发挥作用。piRNA在生殖细胞的生长发育中形成piRNA复合物（piRC），调控转座子沉默，在配子发育的过程中起重要作用。研究表明， piRNA的异常表达与肿瘤等多种疾病相关（Cancer Manag Res. 2019; 11: 5895–5909）。

piRNA与肿瘤。Cancer Manag Res. 2019; 11: 5895–5909