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【基础操作】PWI后处理步骤(三)——BrainStat GVF


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【基础操作】PWI后处理步骤(二)——BrainStat AIF

【基础理论】PWI成像原理与BrainStat AIF算法

【基础操作】PWI后处理步骤(一)——MR Standard

【基础理论】PWI成像原理与MR Standard算法

今天介绍最后一种后处理方法BrainStat GVF,下面以主机举例,AW工作站操作基本相同。

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选择头颅PWI序列,点击FUNCTOOL



各种后处理算法的切换可以点击左侧New Application进入软件列表后进行选择。


进入BrainStat GVF后界面如下,已经自动产生功能图像图,我们先了解一下本界面上的参数意义,再介绍后处理。

 左上为原始数据区,右上为图表区,下方两个窗口为功能图像区。本界面上,红色字体部分均可修改、调整、隐藏,在红色字体区域点击鼠标右键,可进行相应操作;而黄色字体不可修改。


原始数据区

左上角项目:

患者姓名****  上图经隐藏

层面位置:I4.2  点击左右键可翻层

显示视野:DFOV  点击左右键可成倍放大缩小

左下角项目:

相位:phase 1/50    总共采集了50期像,当前为第1期,点击左右键可切换本层面的其他期像

右中边项目:重复时间TR,回波时间TE,激发次数NEX

右上角项目:日期,检查号Ex,序列号Se,图像号Im

 

功能图像区

左上角项目:功能图像名称Blood Flow(Relative),点击鼠标右键可现实所有功能图像并进行切换,左下角窗口和右下角窗口的功能和操作完全一致。

左下角项目:ROI测量值显示,详细见下文

右上角项目:鼠标指针所在区域的坐标位置

 

图表区

X轴期像数,Y轴磁共振信号强度。

【注意】本算法曲线含有两条:红色曲线为伽马函数拟合曲线,绿色线为实际采集的信号强度曲线,含有再循环信息。


开始计算BrainStat GVF

1
点击BrainStat GVF按钮,第一步,Apply registration纠正扫描期间头动。


2
第二步,调阈值。上限值滑块设为最右边,移动左侧最小值滑块,注意保证所有的脑组织被绿线覆盖。所有超出定义范围的MR值将被屏蔽,也就是说,不会对它们进行处理,因此它们会在功能视图上呈现为黑色。这样做可以使得非相关图像数据,如空隙( 包括患者身体以外的空间) 都会被排除在处理范围之外。这部分数据可能会占到总体数据的一半,因此处理时间也会相应地减少。同时从这样的数据中产生的噪音( 尤其是患者身体部位之外的噪音) 不会在功能图上出现。


3
第三步,设置需要剔除的图像,在正常侧大脑灰质区域放置ROI,观察右上角窗口曲线,将PWI计算的起始点设置到曲线下降之前曲线较平坦的期相,一般为5-8左右,之前的图像被认为还没有达到稳态而将被剔除。


4
第四步,点击Compute计算,完成后处理。


5
镜像ROI。


如有必要测量对侧脑区的参数值可以先点击对称轴按钮axis of symmetry,

调整对称轴至脑中线,同时选中对称轴和ROI1,将其激活为绿色高亮

然后点击创建对称ROI按钮create symmetrical ROIs

即可。


功能图像与解剖图像融合

选择解剖定位像,比如Ax 3D BRAVO +C,在功能图像上点击右键菜单,set reference image,下级菜单选择selection,即实现功能像与解剖像的融合。

如果功能图和解剖像不能完全匹配,会出现如下提示信息。如有必要,单击Yes( 是) 继续,在进行3D重新配准后功能图会和解剖像融合。


结果显示

功能图像区左下角项目:

ROI编号,面积:单位mm2,Avg:均值,Min:最小值,Max:最大值,Dev:方差,%:以某个选定的ROI均值为参考,其他各个ROI与之之比。这些项目可以在左下角Pref/Settings里面ROI栏目进行选择。

50%transparent指功能图以50%的透明度叠加于解剖图上,这样有助于观察病变定位,点击鼠标左右键或者中键拖拽可以改变叠加的透明度




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