反渗透工艺决定其必须排放一定量的高含盐量的浓水，才能生产出低含盐量的脱盐水。系统回收率是指反渗透装置在实际使用时的总回收率。系统回收率主要有根据膜元件串联的长度、受给水水质膜元件的数量及排列方式、是否有浓水循环以及循环流量的大小等多种因素的影响。
一般情况下生产为了提高反渗透设备回收率，会把膜元件串联起来，但是如果系统中有很多的膜元件，就不能把他们全部串联，如果这样做，那么第一支膜的给水流量就会很大，系统压力也太大，产水流量分配也不平衡。所以实际使用时，把一定数量的膜元件装在一个压力容器中，然后把压力容器按照一定的排列方式来排列，按照纯水和浓水分别流向一侧的流程，第一组给水装置的浓水流入下一压力容器为第一段，第一段的给水浓水再流人下一个压力容器为第二段，依次类推为其他段，这样就能相应提高设备的加收率，降低原水成本。
但是对于各种反渗透设备，往往需要不止一个反渗透膜元件，这时候这些膜元件就存在如何排列的问题，如前面介绍，膜元件实际回收率是膜元件实际使用时的回收率。小型反渗透设备由于膜元件的数量少给水流程短，因而系统回收率普遍偏低，而工业用大型反渗透装置由于膜元件的数量多给水流程长，所以实际回收率一般均在65％以上（也就是说每制备65吨的脱盐水，需要排放约35吨的反渗透浓水），有时甚至可以达到90％。
对于一级反渗透，第一级回收率R1=第一级产水量/第一级进水量 ×100％；第二级反渗透的回收率为R2=第二级产水量/第二级进水量×100％。而二级反渗透的回收率并不是两个级别反渗透系统回收率的乘积得到的。第二级反渗透系统的浓水不是排放掉了，而是又重新回流到一级反渗透的入口处。因此，多级反渗透设备的回收应当按以下标准计算：系统回收率=总的产水量/总的进水量×100％。
影响回收率的因素主要有哪些？
给水水质中的难溶盐成分指标构成了反渗透膜系统的难溶盐极限回收率。
反渗透膜系统的元件数量、品种及排列方式了浓差极化极限回收率。
系统末端元件浓水流下构成了系统浓水流量极限回收率。
反渗透膜通量均衡度要求构成了系统均衡通量极限回收率。
四项极限回收率中的数值最低项，构成了系统设计回收率的实际限值。提高四项极限回收率中的最低项数值则可有效提高反渗透设备的实际回收率。
尤其是最近几年，政府对总量控制和回用率限定等方面的指标日益严格，迫使企业开始考虑各种水回用技术。相对于废水回收处理的高难度高成本，占产水量1/3的反渗透浓水的回收利用显得更有优势。提高系统的回收率不仅可以更充分利用水资源，还可以降低预处理工艺的投资规模与运行成本，降低膜系统高压泵的规模与能耗，从而有效提高全系统的效率。
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