TCGA与SEER两大癌症数据库首次比较

做生物信息分析会经常看到两个数据库，一个时TCGA数据库，一个是SEER数据库，特别是癌症分析，这两大数据库是绕不开的。随着国内对TCGA数据研究不断深入，越来越多的人选择TCGA数据库作为癌症分析的入口。这也是不用实验，就能获得大量数据进行研究最佳选择。TCGA和SEER两大数据库都是美国国立，用于癌症研究的数据库，很多学员就产生疑问，这两大数据库究竟有什么不同，做分析时需要如何选择。其实两大数据的区别时非常大，如果只用过其中一个数据库，就会对另外一个数据库不了解，如果同时使用过这两大数据库，就很容易发现，其实他们都用于分析癌症，那是研究侧重点和方向时不同的。
1、首先认识一下TCGA和SEER
从网址开始，TCGA数据库：https://cancergenome.nih.gov/；SEER数据库：https://seer.cancer.gov/；打开两个数据库，我们发现这两个数据库的LOGO时一样的，说明TCGA和SEER都是美国NIH这个机构提供的数据库。

2、TCGA和SEER数据库官方定义
TCGA数据库：
美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱（Cancer Genome Atlas，TCGA）计划，试图通过应用基因组分析技术，特别是采用大规模的基因组测序，将人类全部癌症（近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤）的基因组变异图谱绘制出来，并进行系统分析，旨在找到所有致癌和抑癌基因的微小变异，了解癌细胞发生、发展的机制，在此基础上取得新的诊断和治疗方法，最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。
SEER数据库：
美国国立癌症研究所“监测、流行病学和结果数据库”SEER是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一，收集了大量循证医学的相关数据，为临床医师的循证实践及临床医学研究提供了系统的证据支持和宝贵的第一手资料。