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用银离子粘合DNA,形成稳定的G和G配对


《科学报告》发表一篇名为Silver(I) as DNA glue: Ag+-mediated guanine pairing revealed by removing Watson-Crick constraints的文章,该研究利用金属银离子进行了DNA链的粘合,这种纳米水平的金属-DNA反应可能为疾病治疗提供新的希望。


自然情况下构成DNA的四种碱基一般遵循腺嘌呤-胸腺嘧啶(A-T)和鸟嘌呤-胞嘧啶(G-C)的配对,但人类显然并不满足于此。科学家们在和这个神奇双螺旋结构玩耍的过程中作出了丰富的尝试,包括强行配对两个并不“投缘”的碱基,加入人造碱基,甚至打造人造的DNA,以开拓生物科技的新领域。


金属离子与DNA的反应在生物化学和DNA纳米技术中有深远的应用。此前已有研究用Hg2+将两个胸腺嘧啶配对,但汞离子具有毒性。相比之下,银离子Ag+是一种尤其有趣的离子,它们不与DNA骨架发生反应,而是专门结合在碱基上,且不像Hg2+那样具有毒性。


银离子加入碱基时的效果。

Swasey et al.


与之前将Ag+放入双链DNA中的研究不同,来自美国加州大学圣塔芭芭拉分校的Elisabeth Gwinn和同事突破沃森-克里克配对限制,将注意力放在典型碱基的同型碱基DNA低聚物上。出乎意料的是,高分辨率电喷雾电离质谱仪分析显示,以Ag+为媒介的G-G碱基配对双链具有比典型G-C配更高的稳定性。


普通的G-C配对。

Wikipedia

本研究所述,以Ag+为媒介的G-G同型碱基配对。注意其结合位点在普通G-C结合位点的“斜对面”。

Swasey et al.


通过探索各种不受限制的几何结合方案,量子化学计算发现Ag+联结在两个鸟嘌呤的非典型位置上。作者还使用了圆二色光谱分析,结果显示,在一定条件下,以Ag+为媒介的G-G同型碱基双链结构能够承受至少90?°C的高温,而典型G-C双链在不到20°C就熔化了。


Elisabeth Gwinn和同事指出,这些结果在DNA纳米技术和金属离子生物医学方面颇具前景。?




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