1.在Linux系统上搭建Git的环境
安装所需要的一系列软件:
yum install curl-devel expat-devel gettext-devel openssl-devel zlib-devel
yum install gcc-c++ perl-ExtUtils-MakeMaker
下载git文件,解压,准备环境,编译,安装
wget https://www.kernel.org/pub/software/scm/git/git-2.7.0.tar.gz
tar xvf git-2.7.0.ta.gz
cd git-2.7.0
./configure prefix==/data2/gyd/git #configure是shell脚本,会检测平台的目标特征,例如是否安装cc,gcc,并生成Makefile,--prefix 可以特化安装路径
make #编译,从Makefile中读取指令,进行编译
make install #安装
make clean #清除临时文件
以上3步均依赖Makefile
设置环境变量
vim ~/.bashrc_profile
PATH=$PATH:$HOME/bin:/data2/gyd/git/bin
export PETH
source ~/.bashrc_profile
安装成功
git --version
2.安装 Miniconda以及 Bioconda进行软件的管理
下载安装
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-4.3.21-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh
询问的时候默认Yes添加至环境变量
source ~/.bashrc
输入“conda list”来查看已经安装的软件:
添加channels
conda config --add channels bioconda
查看已经添加的channels:
conda config --get channels
更新miniconda
本站仅提供存储服务,所有内容均由用户发布,如发现有害或侵权内容,请
点击举报。