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用R软件处理TCGA数据可能出现的错误

R软件报错:无法分配大小为2.4 Gb的矢量。
解决方法:通过ls()看work space中有什么变量;
                通过object.size()看每个变量占多大内存;
                通过memory.size()查看现在的work space的内存使用;
                通过memory.limit()查看系统规定的内存使用上限;
                通过memory.limit(newLimit)更改到一个新的上限;
                可以使用rm(object)删除变量,然后使用gc()做Garbage collection来释放内存。

 

用命令行下载TCGA数据时报错:
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 21, in <module>
  File "c:\users\cdis\appdata\local\temp\pip-build-n7scbe\PyInstaller\PyInstaller\loader\pyi_importers.py", line 507, in install
  File "c:\users\cdis\appdata\local\temp\pip-build-n7scbe\PyInstaller\PyInstaller\loader\pyi_importers.py", line 156, in __init__
ImportError: Can't load frozen modules.

通常是因为路径中含有中文名字导致的,换成英文就可以正常运行了

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