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肿瘤耐药机制怎么做容易发文章



本次课程讲解的文章也是最近刚发表的,研究的是KDM1A这个分子在肝癌中的耐药机制。为啥选KDM1A,见课程视频。

Targeting KDM1A attenuates Wnt/β-catenin signaling pathway to eliminate sorafenib resistant

stem-like cells in hepatocellular carcinoma


Cancer Lett.         IF:5.992       PMID: 28377178


耐药机制怎么做?


筛选耐药细胞

耐药细胞的筛选有两种办法,一种是文章中用的逐步加药法,增加药物的浓度一步步筛选出耐药细胞。


还有一种就是高浓度冲刷,顾名思义就是直接上高浓度来筛选,能在高浓度药物下茁壮成长的就是耐药的宝宝。


两种方法筛选出的细胞有哪些不同?哪张方法更好?具体解答见视频。

 

筛选出耐药细胞,可以做一些细胞特征和表型研究,如克隆形成能力,表面标志物等等。


差异基因筛选

表型做好,接下去就是探究分子机制了。如何找差异基因了,这个大家都很熟悉,可以测序,也可以用芯片。


但差异基因好找,具体挑哪个差异基因却不容易。在这里呢,王刚老师也给了大家一些很实在的tips,比如说哪些功能基因会和肿瘤发生发张关系会比较密切。

 

功能研究


文章作者挑选了KDM1A,并用干扰和过表达验证了KDM1A在肝癌中耐药的作用,还用突变的方法具体验证了KDM1A蛋白具体的作用位点。


机制研究

这些都弄清楚之后,接下来就是研究KDM1A是具体通过哪些通路,影响了哪些分子以致于让肿瘤产生了耐药性。这又是实验中的一个难题。


文章的作者是怎么找到这个Wnt/β-catenin signaling pathway的呢?一两句话也说不清,大家自己看视频吧。

 

动物实验

细胞实验之后,还得做动物实验,这是做机制绕不开的。文章怎么能在原先的基础之上发得更高一点呢?这里可是有诀窍的。具体怎么做,见视频。

 


文章思路总结起来就是这样的。


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