距离信号通路达人，你只差这一个KEGG“食”用教程（65页精美图文下载）

作者：叶子

转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台

信号通路是基础科研的精粹所在，而掌握通路浩瀚数据的钥匙就是KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）。KEGG——京都基因与基因组百科全书，是日本京都Kanehisa Laboratories根据文献证据手工整理的一个庞大数据库（包括信号通路、基因、疾病、药物等等）。

KEGG有别于其他数据库的一个显著特点就是具有强大的图形功能，它利用直观图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系，简单明了。但初见KEGG也不是这么好用的，因为日本人清奇的脑回路，很(sang)贴(xin)心(bin)的(kuang)在网站里放了16个子数据库。

大多数人看到这里就吓懵了，但其实根本不用方，一般医学科研人员要用的功能很简单。也就是……

1） 根据疾病或者表型找相关通路

2） 根据确定的分子查询相关通路

3） 根据差异分子列表构建通路网络

疾病 & 通路

单分子 & 通路

一组分子 & 通路

通路解读 & 分析

以上内容大家按需取用，找到通路后，课里还讲了对于找到通路后怎么看，通路里的数据要怎么分析。真正的包教包会，一条龙服务。

学完上面这些就结束了？too naïve，解螺旋的风格一向是加量不加价，除了KEGG外，还讲怎么从GEO找数据，一菜双吃，喂饱为止。